Что такое гтц: Главный тормозной цилиндр (ГТЦ): устройство и принцип работы

Содержание

Что такое ГТЦ (главный тормозной цилиндр) в автомобиле: описание

Тормозная система современных автомобилей выполнена в виде двухконтурной системы, т.е. каждый контур отвечает за два колеса транспортного средства. Таким образом, в случае поломки тормозной системы или протечки жидкости выходит из строя только один контур, а, следовательно, два колеса принадлежащих этому контуру. В таком случае автомобиль всегда можно остановить за счет второго контура.

Самым необходимым элементом тормозной системы, отвечающим за безопасность, является главный тормозной цилиндр автомобиля. Сокращенно ГТЦ.

Общее представление о цилиндре

ГТЦ тормозов представляет собой единый корпус, в котором размещаются два поршня. Такой способ изготовления отличается хорошей надежностью. Данный элемент тормозной системы отвечает за распределение равномерного давления в оба контура тормозной системы.

Работает ГТЦ в автомобиле следующим образом: при воздействии на тормозную педаль приводится в действие первый поршень. По мере нажатия увеличивается давление в цилиндре. За счет этого приводится в действие второй поршень, который сжимая тормозную жидкость, заставляет работать свой контур.

При исправной системе тормозов давление в обоих контурах всегда одинаковое. При малейшей утечки жидкости в одном из контуров, одинакового давления соответственно не будет. Появление утечки в системе создаст потерю давления между первым и вторым поршнем, что приведет к неправильной работе ГТЦ. Он просто будет работать как- будто у него один поршень. Соответственно эффективность тормозов будет в несколько раз уменьшена.

Выпускаемые автомобили делятся по типу привода в основном на задний или передний. Необходимо помнить, что на автомобилях с передним приводом двухконтурная система работает по диагонали.

Т.е. если взять один из контуров ГТЦ, то он будет отвечать за работу переднего левого колеса и заднего правого. На автомобилях с задним приводом несколько по другому. Один контур отвечает за передние колеса, другой за задние.

Устройство главного тормозного цилиндра

В основном, главный тормозной цилиндр в машине, располагается на наружной стенке вакуумного усилителя тормозов и крепится при помощи двух болтиков. Конструкция ГТЦ состоит из следующих элементов:

бачек для жидкости;
корпус с цилиндрическим основанием;
возвратные пружины;
основной шток;
поршни и толкатели;
эластичные воротники.

Судя по конструкции можно предположить, что бачек для жидкости располагается в верхней части ГТЦ и имеет перегородки, где хранится нужный объем жидкости для всей системы. За счет специальных перепускных клапанов происходит взаимодействие цилиндра с контурами системы.

Его сущность основана на восполнении объема рабочей жидкости при ее испарении или при износе тормозных колодок. На бачке расположены специальные метки максимума и минимума. Они облегчают визуальную проверку уровня тормозной жидкости.

Как правило, стенки бачка изготовлены из прозрачного материала. Низкий уровень жидкости можно выявить и на приборной панели. Бачек имеет датчик, показывающий ее количество, и в случае низкого уровня загорается лампочка, оповещающая водителя.

В составе и устройстве ГТЦ имеются расположенные друг за другом поршни. На них установлена конструкционная манжета и смазочное кольцо, изготовленное из войлока. Эластичность материала манжеты способствует возможному не протеканию рабочей жидкости.

Один из поршней приводится в действие штоком вакуумника, а второй за счет создаваемого давления от сжатия тормозной жидкости. Специальные пружины фиксируют поршни в цилиндре..

Детальный принцип работы ГТЦ

При нажатии на педаль тормозной системы, первый поршень приходит в движение за счет подталкивающего его штока. При его движении закрываются все перепускные проемы, вследствие чего давление первого контура увеличивается.

За счет увеличения давления приходит в движение второй поршень ГТЦ. За счет перепускных отверстий жидкость заполняет вакуум, который появился при движении. Устройства продолжают движение, пока пружина дает им возможность. Когда достигается максимальное давление, происходит срабатывание механизмов.

При остановке автомобиля оба поршня занимают свое первоначальное положение, за счет пружин возврата. При движении поршня сквозь отверстие давление атмосферы приравнивается к контурному давлению.

Если произошел неожиданный спуск педали, то разрежение в контурах не образуется, потому что все пространство занято поступившей жидкостью. Если вдруг произошла утечка в одном из контуров, второй продолжает свою работу и нехватка компенсируется.

Предположим, первый поршень непринужденно переместился по ГТЦ до соприкосновения со вторым. Второй поршень будет перемещаться, обеспечивая действие тормозов во втором контуре, соответственно произойдет изменение в работе тормозного цилиндра. А именно первый поршень приводит в движение следующий.

Не встретив сопротивления, он упирается в корпус, давление в первом контуре возрастает и влечет за собой остановку автомобиля. Тормоза срабатывают, как и надо, за счет эффективной работы цилиндра.

Показатели неработоспособности

Основными признаками неисправности являются:

при нажатии педали тормоза, проявление рывков;
педаль тормоза проваливается или клинет;
тормоза не прокачиваются;
следы тормозной жидкости на вакууме.

После выявление неисправности ГТЦ, как правило, производят ремонтные работы, которые лучше проводить при наличии смотровой ямы или эстакады. Можно конечно обойтись и без ямы и эстакады, но это значительно может усложнить проводимые работы, поскольку потребуется прокачка колес, а без ямы их нужно будет снимать.

Читайте: Суппорт тормозной системы автомобиля.

Большим плюсом использования ямы является осмотр всех элементов тормозной системы, в том числе и регулировка ручника.

Принцип работ по замене

Первостепенно необходимо слить тормозную жидкость в заранее подготовленную посуду. Далее откручиваем специальным ключом штуцера тормозных трубок прикрепленные к главному тормозному цилиндру. И аккуратнейшим образом незначительно отводим их в сторону.

Затем откручиваем гайки крепления ГТЦ от наружной стенки вакуумного усилителя тормозов. И соответственно происходим к снятию ремонтируемого элемента. Все последующие работы нужно выполнять на плоскости, верстаке или столе, где нет ничего лишнего.

Сталкиваясь с заменой первый раз, не имея опыта разборки, лучше раскладывать разобранные элементы в порядке их снятия. И так сливаем тормозуху, которая осталась в цилиндре, все тщательно протирается, и приступают к разборке механизма.

Исходя из выше сказанного материала становится понятно, что в корпусе главного цилиндра расположены два поршня, поскольку система двухконтурная. В нижней части поршней проделаны конструкционные прорези. Они ограничивают их ход в корпусе цилиндра. В эти прорези входят стопорные болты для фиксации поршней.

Изначально необходимо снять пыльник ГТЦ, после открутить фиксирующий первый поршень болтик. После чего поршень должен выйти под воздействием возвратной пружины. Если этого не произошло, то на него нужно надавить и утопить слегка его внутрь цилиндра. После этого он должен выйти. Повторную операцию проделываем и со вторым поршнем, отводим болт и вытаскиваем поршень. Раскладываем все детали по порядку снятия.

Далее производим смену уплотнительных манжет цилиндра тормоза. В ремкомплекте к ГТЦ обычно прилагается пластиковый конус, который сподручно использовать при замене уплотнительных манжет.

После этого заменяется двух воротничковая манжета, и все детали собираются в обратном порядке. Необходимо знать, что после разборки цилиндра тормоза нужно тщательным образом произвести осмотр зеркала цилиндра. Если имеются раковины на зеркале или просто напросто набит эллипс, который определяется по отсутствию блеска в какой либо части, то цилиндр подлежит замене.

Поскольку замена манжет не даст результата. Попросту их не хватит на долгое время или тормоза не будут прокачиваться. Если все в порядке то заливаем тормозную жидкость. Обязательно прокачиваем все контуры тормозной системы и осуществляем выезд для пробы работоспособности тормозов.

Главный тормозной цилиндр (ГТЦ) в авто является составляющим элементом, от которого зависят жизнь и здоровье, поэтому чтобы избежать отказа тормозов в пути необходимо неукоснительно ликвидировать неисправности связанные с ним.

Поделитесь информацией с друзьями:

ГТЦ — это… Что такое ГТЦ?

ГТЦ — – главный тормозной цилиндр. EdwART. Словарь автомобильного жаргона, 2009 … Автомобильный словарь

Горно-туристический центр ОАО «Газпром» — Вид на ГТЦ «Газпром» и хребет Псехако с пика Чёрная пирамида, хребет Аибга Горно туристический центр ОАО «Газпром» современный горнолыжный комплекс в долине рек Ачип … Википедия

Олимпийские объекты ОАО «Газпром» — В рамках подготовки к Зимней Олимпиаде 2014 года в городе Сочи ОАО «Газпром» реализует программу «Газпром 2014», которая предусматривает строительство и эксплуатацию спортивных, инфраструктурных и энергетических объектов в Сочи [1]. Содержание 1… … Википедия

Чёрная пирамида — Вид на пи … Википедия

Псехако (хребет) — Хребет Псехако … Википедия

УЛЬТРАКОРОТКИЕ ВОЛНЫ — (УКВ) традиционное название диапазона радиоволн, объединяющего метровые, дециметровые, сантиметровые и миллиметровые волны (или диапазоны очень высоких частот ОВЧ, ультравысоких частот УВЧ, сверхвысоких частот СВЧ, крайне высоких частот КВЧ).… … Физическая энциклопедия

ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ФИЗИЧЕСКИЕ КОНСТАНТЫ — постоянные, входящие в ур ния, описывающие фундам. законы природы и свойства материи. Ф. ф. к. определяют точность, полноту и единство наших представлений об окружающем мире, возникая в теоретич. моделях наблюдаемых явлений в виде универсальных… … Физическая энциклопедия

ПОЛУПРОВОДНИКОВЫЙ ДИОД — двухэлектродный полупроводниковый прибор (на основе кремния, арсенида галлия, германия и др.), действие к рого обусловлено св вами р п перехода (наиболее обширный класс П. д.), контакта металл полупроводник либо объёмными эффектами в однородном… … Большой энциклопедический политехнический словарь

ГАННА ЭФФЕКТ — генерация высокочастотных колебаний электрич. тока в полупроводнике с N образной вольт амперной характеристикой (рис.). Г. э. связан с периодич. появлением в кристалле и перемещением по нему области сильного электрич. поля, к рая наз. доменом… … Естествознание. Энциклопедический словарь

Углеродное волокно — материал, состоящий из тонких нитей диаметром от 3 до 15 микрон, образованных преимущественно атомами углерода. Атомы углерода объединены в микроскопические кристаллы, выровненные параллельно друг другу. Выравнивание кристаллов придает… … Википедия

Как проверить ГТЦ

Тестирование главного тормозного цилиндра — это хороший шаг навстречу диагностированию потенциальных проблем в вашем автомобиле. ГТЦ служит для создания давления в тормозной системе. Когда он работает некорректно, необходимое давление не достигается. Эта сниженная функция тормозов весьма опасна, поэтому должна быть определена и устранена так быстро, насколько это возможно, чтобы избежать аварии.

Откройте капот машины и найдите резервуар с тормозной жидкостью. Он будет позади двигательного отсека и представляет собой пластиковый цилиндр с гидравлической жидкостью. Если у вас машина с ручной коробкой передач, то их будет два. Резервуар с тормозной жидкостью большего размера.
Нужно, чтобы кто-то сидел в машине и прокачивал тормоза, пока вы осматриваете резервуар с тормозной жидкостью. Если вы заметили, как в резервуаре формируются завитки или пузырьки во время нажатия на тормоза, то ваш главный тормозной цилиндр не работает должным образом и, скорее всего, нуждается в замене.
Внимательно осмотрите поверхность вокруг главного цилиндра на предмет утечек жидкости. Если вы заметите малейшую утечку тормозной жидкости из цилиндра, это значит, что он работает некорректно, его необходимо заменить. Тем не менее, если жидкость сочится из близлежащих тормозных шлангов или трубок, тогда, возможно, проблема не в главном тормозном цилиндре.
Надавите на педаль тормоза до тех пор, пока не остановится, а затем удерживайте педаль на месте, обеспечивая давление. Если после того, как педаль тормоза придет с исходное положение, она снова начнет медленно проваливаться, в таком случае главный цилиндр работает не совсем подобающим образом и, вероятно, требует замены.
Определите, действительно ли проблема в главном цилиндре. Если нет протечек жидкости на главном цилиндре, никаких воронок или пузырьков в резервуаре с тормозной жидкостью, а педаль тормоза не снижается при постоянном давлении, то тогда главный цилиндр работает как надо.

Помните, ремонтом автомобиля должны заниматься профессионалы! Приезжайте в СТО «Техника», мы поможем выявить и устранить любые неисправности тормозной системы вашего автомобиля!

устройство, проверка и прокачка (основные неисправности ГТЦ)

Гидравлическая система привода тормозов автомобиля начинается с устройства, которое должно преобразовать механическое усилие на педали в давление рабочей жидкости. В этой роли выступает гидроцилиндр, названный по занимаемому им месту «главным». При этом все прочие не являются второстепенными, их именуют рабочими или исполнительными.

Содержание статьи:

Назначение ГТЦ в автомобиле

Начинается торможение с нажатия педали. Пока можно не рассматривать всевозможные умные системы помощи водителю, которые прекрасно справляются и при без его участия.

Максимум, что поддержит ногу человека, пожелавшего замедлить автомобиль, это вакуумный усилитель тормозов (ВУТ), расположенный между педальным узлом и первым гидравлическим устройством в цепочке, заканчивающейся тормозными колодками.

Совместное действие мускульной силы и атмосферы через мембрану ВУТ должно повысить давление во всей гидросистеме. Если в дело не вмешиваются клапаны и насосы системы АБС, то это давление одинаково в любой точке.

Жидкости несжимаемы, именно поэтому они и применены в тормозах легковых автомобилей. До этого использовались не менее несжимаемые твёрдые тела в виде тяг и тросиков привода колодок первых машин.

Непосредственно давление создаётся именно поршнем главного тормозного цилиндра (ГТЦ). За счёт несжимаемости оно очень быстро нарастает, каждый водитель чувствовал, как твердеет педаль под ногой после выбора её свободного хода.

Сброс давления после отпускания педали и пополнение магистралей жидкостью, когда это потребуется, тоже являются функциями ГТЦ.

Принцип работы

Одноконтурные ГТЦ, где имелся всего один поршень, уже не встречаются в автомобилях, поэтому рассматривать стоит лишь двухконтурный. Он отличается наличием двух поршней, каждый из которых отвечает за давление в своей ветке системы.

Таким образом тормоза дублируются, чего требует обеспечение безопасности. Если возникнет утечка жидкости, то оставшаяся в исправности ветка позволит остановить машину без применения стояночного тормоза и прочих аварийных приёмов.

Первый поршень непосредственно соединён со штоком педали. Начав движение вперёд, он перекрывает перепускные и компенсационные отверстия, после чего усилие через объём жидкости будет сразу же передано на колодки первого контура. Они прижмутся к дискам или барабанам, и начнётся замедление с помощью сил трения.

Взаимодействие со вторым поршнем производится через короткий шток с возвратной пружиной и жидкость первого контура. То есть поршни соединяются последовательно, отсюда такие ГТЦ и получили название тандемных. Поршень второго контура работает аналогично на свою ветку системы.

Обычно рабочие колёсные цилиндры работают по диагонали, то есть в каждый контур подключено одно переднее и одно заднее колесо. Так сделано с целью в любом случае задействовать передние, более эффективные тормоза, хотя бы частично.

Но встречаются машины, в которых по конструкционным причинам один контур работает только на передние колёса, а второй на все четыре, для чего используются дополнительные наборы колёсных цилиндров.

Устройство

В состав ГТЦ входят:

корпус со штуцерами, подводящими жидкость от расходного бачка и отводящими к магистралям рабочих цилиндров;
поршни первого и второго контуров;
уплотнительные резиновые манжеты, расположенные в проточках поршней;
возвратные пружины, сжимающиеся при движении поршней;
пыльник, прикрывающий место входа штока от ВУТ или педали в углубление тыльной стороны первого поршня;
резьбовая пробка, закрывающая цилиндр с торца, открутив которую можно собрать или разобрать цилиндр.

Компенсационные отверстия расположены в верхней части корпуса цилиндра, они могут перекрываться при движении поршней, разобщая полость высокого давления и расходный бачок с запасом жидкости.

По теме: Что такое тормозной суппорт и как он работает (виды, устройство, ремонт)

Сам бачок обычно прикреплён непосредственно к цилиндру через уплотняющие манжеты, хотя может быть и вынесен в иное место подкапотного пространства, а соединение производится через шланги низкого давления.

Основные неисправности

Поломки в главном тормозном цилиндре практически исключены, а все неисправности связаны с пропусканием жидкости через уплотнения:

износ и старение уплотнительных манжет со стороны штока, жидкость уходит в полость вакуумного усилителя или при его отсутствии в салон, на ноги водителю;
аналогичные нарушения работы манжет на поршнях, цилиндр начинает перепускать одним из контуров, педаль проваливается, торможение ухудшается;
подклинивания поршней из-за коррозии их самих и зеркала цилиндра, а также при потере упругости возвратных пружин;
увеличение хода и снижение жёсткости педали при торможении из-за завоздушивания тормозной магистрали.

Для некоторых автомобилей до сих пор сохранились в каталогах запасных частей ремонтные комплекты с поршнями и манжетами. Как и рекомендации по удалению дефектов поверхности цилиндров наждачной бумагой.

Практически это занятие особого смысла не имеет, заметно продлить ресурс отработавшего своё ГТЦ вряд ли получится, а ездить с ненадёжным гидроцилиндром тормозов, который не зря называется главным, неприятно и опасно. Поэтому в подавляющем числе случаев цилиндр меняется на новый в сборе.

Как проверить и прокачать главный тормозной цилиндр

Проверяется ГТЦ по симптомам возникшей проблемы с тормозами. Обычно это проваливающаяся или ставшая мягкой педаль с увеличенным ходом. Если проверка всех рабочих цилиндров и шлангов не даёт признаков неисправности, значит заключена она в главном, который и следует заменить.

Можно приблизительно оценить работоспособность, ослабляя поочерёдно штуцеры тормозных трубок от ГТЦ и наблюдая за интенсивностью утечек при нажатии на педаль. Но особой необходимости в этом нет, поработавший ГТЦ заменяется при малейших подозрениях, безопасность дороже.

Это надо знать: 4 способа восстановления аккумулятора автомобиля в домашних условиях

При замене цилиндр заполняется свежей жидкостью, а лишний воздух уходит в бачок через перепускные отверстия, поэтому особой необходимости в отдельной прокачке нет. Достаточно многократного нажатия на педаль при общей прокачке системы через клапаны рабочих механизмов.

Если же по какой-то причине потребуется прокачать и ГТЦ, то для этого, работая вдвоём, последовательно перекрываются выходные штуцеры, кроме одного. Через него и уходит воздух путём открывания его перед нажатием педали и закрытием перед отпусканием.

Нет необходимости даже отсоединять трубки, достаточно их «подрывать», слегка ослабляя накидную гайку. При этом надо следить за достаточным количеством жидкости в бачке.

Сохранность цилиндра и обеспечение его долгой службы обеспечивается своевременной регламентной заменой тормозной жидкости с промывкой системы. Со временем туда попадает вода, забираемая гигроскопичным составом из воздуха.

В результате не только падает температура кипения, что опасно, но и начинается коррозия поверхностей поршней и цилиндров, а манжеты теряют эластичность. Процедуру рекомендуется проводить раз в два года.

Главный тормозной цилиндр: устройство, проверка и прокачка (основные неисправности ГТЦ)

Автор Master OffRoad На чтение 12 мин. Просмотров 7.1k. Опубликовано 19.01.2021

Главный цилиндр: его назначение и функции

Общий вид главного тормозного цилиндра

В процессе торможения происходит непосредственное воздействие водителя на педаль тормоза, которое передается на поршни главного цилиндра. Поршни, воздействуя на тормозную жидкость, приводят в действие рабочие тормозные цилиндры. Из них, в свою очередь, выдвигаются поршни, прижимающие тормозные колодки к барабанам или дискам. Работа главного тормозного цилиндра основана на свойстве тормозной жидкости не сжиматься под действием внешних сил, а передавать давление.

Главный цилиндр выполняет следующие функции:

передача механического усилия с педали тормоза с помощью тормозной жидкости к рабочим цилиндрам;
обеспечение эффективного торможения автомобиля.

В целях повышения уровня безопасности и обеспечения максимальной надежности системы предусмотрена установка двухсекционных главных цилиндров. Каждая из секций обслуживает свой гидравлический контур. В заднеприводных автомобилях первый контур отвечает за тормоза передних колес, второй – задних. В переднеприводном автомобиле тормоза правого переднего и левого заднего колес обслуживает первый контур. Второй – отвечает за тормоза левого переднего и правого заднего колес. Данная схема называется диагональной и получила наибольшее распространение.

Устройство главного цилиндра

Принцип действия и устройство главного тормозного цилиндра схож с главным вальцом сцепления, учитывая, что во многих автомобилях один механизм выполняет двойную функцию. Но во многих автомобилях в тормозном вальце расположены два поршня для работы переднего и заднего или левого и правого контура, в зависимости от марки машины. Произведя разборку главного тормозного цилиндра можно увидеть такие основные запчасти:

1, 2 — Крышка бачка с прокладкой. 3 — Бачок главного тормозного цилиндра. 4 — Втулки под перепускной штуцер. 7 — Корпус бачка. 10, 28 — Возвратные пружины. 12, 26 — Внутренние манжеты. 13, 25 — Перепускные клапаны. 14 — Поршень, включающий передние тормоза. 15, 16 — Наружные манжеты переднего привода тормозов. 20, 22 — Наружные манжеты заднего привода тормозов. 24 — Поршень, отвечающий за работу задних тормозов.

Схема главного тормозного цилиндра автомобиля

шток вакуумного усилителя тормозов;
стопорное кольцо;
перепускное отверстие первого контура;
компенсационное отверстие первого контура;
первая секция бачка;
вторая секция бачка;
перепускное отверстие второго контура;
компенсационное отверстие второго контура;
возвратная пружина второго поршня;
корпус главного цилиндра;
манжета;
второй поршень;
манжета;
возвратная пружина первого поршня;
манжета;
наружная манжета;
пыльник;
первый поршень.

В корпус такого цилиндра, помещены два поршня (12 и 18), которые располагаются один за другим. Второй поршень, является свободно установленным, в то время когда первый поршень, взаимодействует со штоком усилителя тормозов, который в него упирается. Резиновые манжеты, выполняют функции уплотнителей поршней, которые, как уже известно, находятся в корпусе цилиндра. Возвратные пружины (2 штуки «9, 14»), выполняют удержание и возвращение поршней.

Принцип работы

Симптомы неполадок

Общее техническое состоянием автомобиля (в том числе тормозной системы) можно проверить с помощью персонального диагностического адаптера – автосканера. Данного рода устройства широко распространены и имеют широкий ценовой диапазон. Мы же хотим обратить ваше внимание на бюджетную модель корейского производства Scan Tool Pro Black Edition.

При стоимости около 2т.р. данный сканер способен полностью диагностировать ваш автомобиль (двигатель, коробку передач, трансмиссию, abs, srs и многое другое), что окупится за 1-2 поездки на СТО. Адаптер достаточно прост в управлении, имеет русифицированное ПО и совместим с большинством автомобилей начиная с 1993 года выпуска. Так же устройство будет полезным при покупке подержанного автомобиля, так как способно показать его реальный пробег и VIN.

Жидкостная система тормозов состоит из множества деталей, способных прийти в негодность: трубки, рабочие цилиндры колес, суппорты, барабаны и колодки. Характерные признаки неисправности главного тормозного цилиндра:

После нажатия педали автомобиль останавливается медленно. Причина – манжеты одного либо двух поршней потеряли герметичность – потрескались или «поплыли».
Для замедления нужно сильно давить педаль тормоза. Явление возникает из-за набухания резины поршневых уплотнителей.
Слишком короткий ход тормозной педали. Жидкости внутри цилиндра некуда деваться, поскольку компенсационное отверстие засорилось. Другой вариант – проход перекрыт разбухшим резиновым уплотнителем.
Распространенный симптом – провал педали, тормоза включаются в конце хода. Свидетельствует о полном износе манжет, в результате жидкость проникает за поршень и устремляется в расширительный бачок – цилиндр «перепускает».
Колодки не отпускают тормозные диски и барабаны, при движении сильно греются. Варианты: заклинил один из поршней либо засорилось перепускное отверстие.

Перечисленные признаки неисправности ГТЦ схожи с неполадками других элементов. Провал педали также случается при подпадании большого количества воздуха в трубки либо потере жидкости в одном из рабочих цилиндров. Вялое замедление и повышение силовой нагрузки на педаль часто вызывается поломкой вакуумного усилителя – трещиной мембраны или отсутствием герметичности на стыках шланга, отбирающего разрежение двигателя.

Существуют признаки, явно указывающие на работоспособность главного гидроцилиндра и неисправность прочих элементов:

в процессе торможения машину уводит в сторону – проблема кроется в определенном контуре или колесе;
заклинивание тормозных механизмов одного колеса;
скрип и писк при торможении;
нагрев дисков и колодок на одном колесе.

Если отсеять указанные симптомы, станет легче проверить главный тормозной цилиндр в условиях гаража. Сюда же относятся явные протечки тормозной жидкости и стук изношенных суппортов.

Есть и другие симптомы, свидетельствующие о неисправности ГТЦ

Во время торможения на скорости автомобиль уводит в сторону. Такое случается, когда неисправен один из контуров или тормозных цилиндров на колесе.
Появление скрипа или стука во время торможения. Это могут быть и колодки, которые пора заменить, однако бывает, что проблема в ГТЦ.
Колодки могут клинить, нагреваться и нагревать тормозной диск на том или ином колесе.

Причины неисправности в устройстве ГТЦ

При нарушении герметичности в одном из контуров давление между первичным и вторичным цилиндром теряется. Это приводит к тому, что ГТЦ функционирует так, будто он обладает лишь одним контуром. Толкатель начнет передвигать оба поршня в исправном контуре до момента, пока поршень неисправного не достигнет торца цилиндрового корпуса. Соответственно, в разгерметизированной камере обеспечится требуемое давление. Если механизм «холостого хода» нормально отрегулирован, ТС эффективно замедлит автомобиль даже в условиях своей неполноценности.

Вот некоторые признаки неисправности в устройстве ГТЦ:

разгерметизация цилиндра определяется по наличию течи на корпусе и специфическому запаху;
износ тормозных колодок характеризуется характерным скрипом и протечкой тормозной жидкости;
заклинивание регулятора, который распределяет усилие тормоза. В этом случае обязательно требуется прочистить тело цилиндра. Наблюдается низкий порог чувствительности педали тормоза, её приходится буквально «утапливать» в пол;
педаль заваливается в пол — эта поломка образуется вследствие неработающих поршней. Если они не в состояние выработать нужное давление, то колодки не могут нормально сжиматься;
повышение хода тормозной педали — признак того, что произошло завоздушивание ТС. Эксплуатация автомобиля в таком состоянии опасна, т. к. велик риск перегреть ТС до закипания. Устранить эту неприятность поможет прокачка.

Если что-то из вышеперечисленного происходит постоянно, можно говорить о повреждении клапана вакуумного усилителя либо полной потери герметичности в системе. Если поврежден сам металлический корпус или имеются задиры на поршне, требуется полная замена ГТЦ. При износе прокладки меняются все составляющие ремкомплекта (уплотнительные манжеты, резиновые прокладки, пружины).

Как прокачать главный тормозной цилиндр? Надо открутить клапан сброса воздуха в корпусе цилиндра и надавливать на педаль до вытекания идеально равномерной жидкости, без примеси воздуха. По завершении клапан возвращается на место и резервуар необходимо заполнить жидкостью заново. Последовательность прокачки механизмов такова: 1 — задний правый; 2 — передний левый; 3 — задний левый; 4 — передний правый.

Частой причиной неисправности этого элемента становится потеря герметичности корпуса и утечка тормозной жидкости. Дефект, вызывающий утечку тормозной жидкости, — протечка задней манжеты, определить её можно по наличию замасливания в месте стыка ГТЦ и вакуумного усилителя. Это может происходить вследствие пробоя гибких трубок из-за трения о вращающееся колесо.

Хорошо, если в области прохождения магистрали через арку она защищена специальной пружиной, не дающей колесу перетирать элемент. Если уровень жидкости снижен, надо проверить герметичность всей ТС и заменить поврежденную трубку.

Как проверить главный тормозной цилиндр

Техобслуживание и диагностика авто предусматривает проверку уровня тормозной жидкости каждую неделю: при резком уменьшении можно судить об утечках. Кроме того, ее важно своевременно менять, так как со временем ухудшается качество жидкости, что приводит к преждевременному износу частей. Стоит обращать внимание и на совместимость с манжетами, так как некоторая автохимия может их повредить. И, конечно, следует своевременно менять все резиновые уплотнители, обращая внимание на заявленный производителем срок службы. Оптимальным будет прибегать к ремкомплекту со всеми резинками каждые 100 тысяч км пробега, и лучше не экономить на качестве комплектующих.

При появлении симптомов неисправности ГТЦ желательно проверить его, и начать необходимо с визуального осмотра. Если при осмотре корпуса будут обнаружены капли тормозной жидкости, следует демонтировать гидроцилиндр для поиска проблемы с герметичностью. Также к распространенным неполадкам можно отнести перетекание жидкости через уплотнители, что несложно проверить: если при нажатии на педаль из бачка будет слышаться бульканье, уплотнители подлежат замене. И, конечно, особое внимание стоит уделить поведению педали: как уже отмечалось, короткий ход или провалы могут говорить о необходимости чистки цилиндра и замены всех резиновых элементов. Лучше всего об их состоянии можно судить, демонтировав деталь и разобрав ее: иногда помимо незначительных повреждений прокладок можно обнаружить и трещину в самом цилиндре. В таком случае деталь придется заменить целиком.

Видео на тему

Работа системы при выходе из строя одного из контуров

Устройство двухконтурного тормозного привода

В случае утечки тормозной жидкости в одном из контуров – второй продолжит работу. Первый поршень будет перемещаться по цилиндру до контакта со вторым поршнем. Последний начнет перемещение, за счет которого произойдет срабатывание тормозов второго контура.

Если произойдет утечка во втором контуре, главный тормозной цилиндр будет работать по другой схеме. Первый клапан за счет своего движения приводит в действие второй поршень. Последний двигается беспрепятственно до достижения упором торца корпуса цилиндра. За счет этого начинает расти давление в первом контуре, и происходит торможение автомобиля.

Даже при увеличении хода педали тормоза вследствие утечки жидкости автомобиль сохранит управление. Однако торможение будет не столь эффективным.

Ремонт главного цилиндра

После того как произвели снятие главного тормозного цилиндра, стоит произвести осмотр на предмет механических повреждений, если их нет, нужно разобрать его и поменять вышедшие из строя запчасти, на те, которые находятся в ремкомплекте. Произведя разбор главного тормозного цилиндра, в любом случае надлежит поменять все резиновые запчасти – манжеты и пр. Принцип разборки своими руками прост:

предварительно закрепив его в тисках, из корпуса выкручиваем штуцеры подвода жидкости;
отверткой снимаем стопорное кольцо;
аккуратно разобрать и вынуть манжеты, поршни, пружины и прочие запчасти.

Очистив все составляющие и промыв их в гидравлической жидкости, требуется внимательно осмотреть внутреннее зеркало корпуса на предмет задиров и прочих повреждений. Если выявлены разбухшие манжеты, стоит поменять гидравлическую жидкость, плохое качество которой может быть причиной такого явления. Одним из табу является регулировка и ремонт регулятора давления, у которого параметры выставлены производителем, его замена производится в комплекте.

Сборка главного тормозного цилиндра производится в обратном порядке. Поменяв требующие замены запчасти: штуцер, комплект манжетов и другие на новые, возникает вопрос, как проверить главный тормозной цилиндр после сборки?Для этого существует специальный стенд, состоящий из таких узлов:

Клапаны прокачки.
Манометры.
Поглощающие вальцы.
Бачок с гидравлической жидкостью.
Указатель максимального смещения.
Механический маховик.
Корпус главного вальца.

Этот стенд поможет определить, правильно ли произведена сборка своими руками. После установки главного вальца на место нужно прокачать систему тормозов. Если же найдены механические повреждения на корпусе, то требуется замена главного тормозного цилиндра на новый.

Заключение

Корректная работа главного цилиндра — залог безопасного управления автомашиной и обеспечения сохранности жизни водителя и других участников дорожного движения. Потому контроль за правильным функционированием тормозной системы должен осуществляться регулярно.

Источники

https://TechAutoPort.ru/hodovaya-chast/tormoznaya-sistema/glavnyi-tormoznoy-cilindr.html
https://seite1.ru/zapchasti/glavnyj-tormoznoj-cilindr-i-vsechto-nuzhno-o-nem-znat/.html
https://fastmb.ru/auto_shem/24-glavnyy-tormoznoy-cilindr-shema-i-princip-raboty.html
https://AutoVogdenie.ru/kak-rabotaet-glavnyj-tormoznoj-cilindr.html
https://autochainik.ru/neispravnosti-gtc.html
https://vopros-avto.ru/kak-proverit-gtcz-priznaki-neispravnosti-glavnogo-tormoznogo/
https://auto-gl.ru/ustroystvo-glavnogo-tormoznogo-cilindra-i-5-osnovnyh-priznakov-ego-polomki/
https://AvtoNov.com/%D0%B3%D0%BB%D0%B0%D0%B2%D0%BD%D1%8B%D0%B9-%D1%82%D0%BE%D1%80%D0%BC%D0%BE%D0%B7%D0%BD%D0%BE%D0%B9-%D1%86%D0%B8%D0%BB%D0%B8%D0%BD%D0%B4%D1%80-%D1%87%D1%82%D0%BE-%D1%8D%D1%82%D0%BE/

Замена и ремонт главного тормозного цилиндра

Конструкция и принцип работы главного тормозного цилиндра (ГТЦ) на любом автомобиле с вакуумным усилителем тормозов (ВУТ) одинаковы. Именно ГТЦ обеспечивает необходимое давление тормозной жидкости, поэтому эффективность тормозов напрямую связана с его состоянием.

Устройство главного тормозного цилиндра

Основа ГТЦ – чугунная литая труба с полированной внутренней поверхностью, в которой перемещаются поршни. Когда водитель нажимает на тормоз, прикрепленный к педали шток приводит в действие ВУТ. Шток ВУТ нажимает на задний поршень ГТЦ, который перекрывает компенсационное отверстие и создает давление в тормозных трубках.

По мере продвижения вперед, задний поршень поднимает давление в передней камере как через переходные отверстия, так и с помощью пружины, которой он соединен с поршнем переднего цилиндра. Поршень переднего цилиндра начинает двигаться, перекрывает компенсационное отверстие и поднимает давление в передней камере и тормозных трубках.

Неисправности ГТЦ

Основные неисправности главного тормозного цилиндра:

износ резиновых уплотнительных элементов;
образование царапин и ржавчины на внутренней поверхности ГТЦ;
попадание воздуха внутрь ГТЦ.

Во время торможения сильно возрастает температура в рабочих цилиндрах, что ведет к сильному нагреву тормозной жидкости. Через 1 – 2 года свойства жидкости начинают меняться, это приводит к повышенному износу резиновых уплотнений. Ведь в жидкость попадают частицы металлических окислов и гидроксидов, а также микроскопические фрагменты резиновых уплотнений. В результате уплотнители, а нередко и внутренняя поверхность ГТЦ изнашиваются, это приводит к появлению утечек тормозной жидкости.

Если где-то в тормозной системе присутствует даже небольшая утечка, уровень жидкости в бачке будет постоянно понижаться. При достижении критического значения внутрь ГТЦ может попасть воздух, это сильно снизит эффективность торможения. Чем больше воздуха, тем хуже работает система. В некоторых случаях тормоза срабатывают только с 4 – 5 нажатия на педаль.

Как снять главный тормозной цилиндр

Технология демонтажа ГТЦ на любом автомобиле одинакова. Сначала шприцем откачивают тормозную жидкость из бачка (бачок можно снимать как на машине, так и после демонтажа ГТЦ). Затем с помощью специального ключа откручивают наконечники тормозных трубок (желательно сразу же надеть на них резиновые колпачки). После этого откручивают гайки крепления ГТЦ к ВУТ и снимают цилиндр.

Разборка и ремонт ГТЦ

После демонтажа ГТЦ необходимо внимательно осмотреть его на предмет утечки жидкости. Если задний сальник влажный или мокрый, скорее всего, часть тормозной жидкости попала в ВУТ и разъедает его мембраны. Необходимо шприцем и тонкой трубочкой откачать жидкость из ВУТ.

Для разборки ГТЦ слейте с него жидкость, затем аккуратно зажмите в тисках таким образом, чтобы отверстия для установки бачка оказались внизу. Открутите стопорные винты, которые не позволяют поршням возвращаться излишне далеко. Извлеките ГТЦ из тисков и с помощью съемника снимите стопорное кольцо со стороны ВУТ. Вытащите первый поршень и пружину. Нередко второй поршень выходит с трудом, поэтому приходится или стучать ГТЦ по деревянному бруску, или глушить одно из отверстий дальнего цилиндра с помощью подходящего болта и подключать ко второму отверстию компрессор с давлением не меньше 6 атмосфер. Вытаскивая поршни, обязательно запоминайте, как установлены резиновые уплотнители и как расположены поршни, это очень поможет при сборке.

Внимательно осмотрите внутреннюю поверхность ГТЦ. Любые царапины ведут к снижению эффективности торможения, поэтому недопустимы. Если на внутренней поверхности обнаружены царапины, корпус или ГТЦ целиком необходимо заменить. Убедившись, что внутренняя поверхность ГТЦ не имеет повреждений, покупайте соответствующий ремкомплект. При выборе ремкомплекта отдавайте предпочтение изделиям, которые изготовлены предприятиями-партнерами крупных автопроизводителей. Нередко оригинальные ремкомплекты от одной марки или модели подходят к другой.

Снимите все старые резиновые уплотнители с поршней. Промойте поршни водой и просушите сжатым воздухом. Установите новые уплотнители из ремкомплекта. Перед установкой обязательно смажьте их тормозной жидкостью, это облегчит их посадку на место и предотвратит повреждение. Не перепутайте направление установки манжет. Перед сборкой ГТЦ промойте его корпус водой с моющими средствами, просушите сжатым воздухом и обильно смажьте тормозной жидкостью. Не используйте для промывки бензин или другие нефтепродукты, если вы некачественно смоете их, то они разъедят резиновые уплотнители. Установите на место поршни, закрутите стопорные болты, вставьте задний сальник и стопорное кольцо.

Установка и прокачка ГТЦ

Установку выполняйте также, как демонтаж, только в обратной последовательности. После того как затянули наконечники трубок, заливайте тормозную жидкость. Теперь необходимо прокачать главный тормозной цилиндр. Попросите помощника 4 раза плавно и до упора нажать на педаль тормоза, затем нажать еще раз и не отпускать. Ослабьте задний правый наконечник тормозной трубки, чтобы из-под него потекла тормозная жидкость. После того, как жидкость и воздух перестанут выходить, затяните наконечник и разрешите помощнику отпустить педаль тормоза. Повторите эту процедуру 3 – 4 раза для каждой трубки.

В половине случаев такой подход позволяет избежать полной прокачки тормозов. После прокачки педаль тормоза должна быть очень тугой. Заведите двигатель, и несколько раз нажмите педаль тормоза. Если она легко продавливается больше, чем на 1/6 часть хода, необходима полная прокачка тормозов. Выезжайте на любой прямой участок, где можно без помех разгоняться и тормозить. Разгонитесь до 5 – 10 километров в час и нажмите на тормоз, чтобы убедиться, что тормоза работают. Если все нормально, разгонитесь до 30 километров в час, затем резко и сильно нажмите на педаль тормоза. Если машина будет тормозить быстро и без увода в стороны, вы все сделали правильно. Если автомобиль повело в сторону, необходима полная прокачка тормозов.

Главный тормозной цилиндр на Subaru Outback (Субару Аутбек) 2, 3, 4, 5, BM, BR, BS, B12, B13, B14 | 2.0, 2.5, 3.0, 3.6

Условия доставки главных тормозных цилиндров для Subaru Outback 2, 3, 4, 5, BM, BR, BS, B12, B13, B14 в Киеве и других городах Украины

После консультации у менеджера интернет магазина ukrparts.com.ua, Вы легко приобретете нужные запчасти к авто. Масштабный ассортимент главных тормозных цилиндров идеального качества для машин Subaru 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019 годов, с объёмом двигателя 2.0, 2.5, 3.0, 3.6 и кузовами универсал.

Вы имеете возможность подобрать оригинальные главные тормозные цилиндры для Subaru Outback 2, 3, 4, 5, BM, BR, BS, B12, B13, B14 с помощью одного из удобных для Вас условий:

— указав год сборки, а также вариант автомобиля Subaru в меню выбора автомобиля на странице;

— по конкретному Vin коду (номеру кузова) машины, созвонившись с нашими работниками;

— по коду комплектующих для машины (каталожному номеру), вписав его в специальном поисковой форме в верху страницы.

Для быстрого заказа в онлайн магазине оригинальных запчастей ukrparts.com.ua доступно крупное количество запчастей для авто. Если у Вас есть вопросы, по подбору такой детали на автомобиль как гтц — обращайтесь за советом к нашему менеджеру. Вам помогут выбрать из обширного ассортимента оригинальных главных тормозных цилиндров такие авто детали, которые идеально подойдут.

Дополнительные названия автозапчасти: гтц.

Наш интернет магазин деталей на авто Укрпартс привезет товар из категории главных тормозных цилиндров клиентам из городов: Черкассы, Ровно, Павлоград, Николаев, Белая Церковь, Мелитополь и в любой уголок Украины. Характеристики и внешний вид автомобильных запчастей могут различаться в зависимости от года выпуска автомобиля. Наши продавцы точно знают и укажут, какие запчасти для автомобиля подойдут конкретно Вам.

Что означает GTZ? Бесплатный словарь

Uniroyal Tyres представила два новых продукта: Tiger Paw GTZ All-Season 2 и вездеход Laredo AWT 3. В соответствии с соглашением, подписанным министром планирования и международного сотрудничества Абдул-Каримом аль-Архаби и министром технического образования. и профессиональное обучение Ибрагим Хаджри и Фонд г-жи Морарки из GTZ также побудили GTZ принять участие в BIO-FACH в Мумбаи. Мероприятие было организовано при финансовой поддержке женской федерации и Немецкого агентства технического сотрудничества (GTZ), добавила она. изделия ручной работы изготавливались членами федерации.Да благословит Бог Хабиба Салима Любой, кто имел дело с GTZ, Немецким правительственным агентством по техническому сотрудничеству, в течение последнего десятилетия или около того, должен помнить, что один из выдающихся должностных лиц этого очень уважаемого двустороннего агентства помощи в Йемене официально и среди общественности , был покойный Хабиб (или Хабиб) Салим. Резюме: Более восьмидесяти участников из тридцати стран Африки, Азии и Европы принимают участие в третьем африканском семинаре экспертов по профессиональному обучению, который состоится 18-20 октября 2010 г. в Гаммарте совместно с Французское агентство развития (AFD) и Немецкое агентство технического сотрудничества (GTZ).Даже если вода будет храниться тысячу лет, ее качество не пострадает », — сказал Gulf News д-р Джордж Козиоровски, главный гидролог gtz International Services, во время полевой поездки на площадку проекта по хранению и восстановлению водоносных горизонтов (ASR) в Ливе. в среду. Немецкая арабская промышленно-торговая палата (GACIC) и Федерация немецкой промышленности (BDI) совместно организуют здесь первый Германский арабский энергетический форум (GAEF) в сотрудничестве с Лигой арабских государств, Европейской комиссией, Германской организацией по вопросам энергетики. Техническое сотрудничество (GTZ) и Генеральный союз арабских торгово-промышленных палат с 14 по 15 октября 2010 г.GTZ сделал это возможным, продемонстрировав свою решительную поддержку в этом году в качестве со-ведущего конференции. Проект искусственной подпитки воды в Абу-Даби, надзор за которым осуществляет GTZ, немецкая государственная организация по техническому сотрудничеству, приближается к решающей стадии. .Technische Zusammenarbeit (GTZ), Корпоративный совет по Африке (CCA) и Фонд PharmAccess.

GTZ Значение в медицине — Что означает GTZ в медицине? Определение GTZ

означает GTZ — Gesellschaft Technische Zusammenarbeit, а другие значения расположены внизу, которые имеют место в медицинской терминологии, а GTZ имеет одно значение.Все значения, которые принадлежат аббревиатуре GTZ, используются только в медицинской терминологии, другие значения не встречаются. Если вы хотите увидеть другие значения, нажмите ссылку «Значение GTZ». Таким образом, вы будете перенаправлены на страницу, где указаны все значения GTZ.
Если внизу не указано 1 аббревиатура GTZ с разными значениями, выполните поиск еще раз, введя такие структуры вопросов, как «что означает GTZ в медицине, значение GTZ в медицине». Кроме того, вы можете выполнить поиск, набрав GTZ в поле поиска, которое находится на нашем веб-сайте.

Значение астрологических запросов

GTZ Значение в медицине

Gesellschaft Technische Zusammenarbeit

Также вы можете найти значение GTZ для медицины в других источниках.

Что означает GTZ для медицины?

Скомпилированы запросы аббревиатуры GTZ в Medical в поисковых системах. Были выбраны и размещены на сайте наиболее часто задаваемые вопросы по аббревиатуре GTZ для медицины.

Мы думали, что вы задали аналогичный вопрос GTZ (для медицины) поисковой системе, чтобы найти значение полной формы GTZ в медицине, и мы уверены, что следующий список запросов GTZ для медицины привлечет ваше внимание.

Что означает GTZ для медицины?
GTZ означает Gesellschaft Technische Zusammenarbeit.
Что означает аббревиатура GTZ в медицине?
Аббревиатура GTZ в медицине означает «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».
Что такое определение GTZ?
GTZ определение: «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».
Что означает GTZ в медицине? Номер
GTZ означает «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit» для медицины.
Что такое аббревиатура GTZ? Акроним
GTZ — Gesellschaft Technische Zusammenarbeit.
Что такое стенография Gesellschaft Technische Zusammenarbeit?
Сокращенное название «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit» — GTZ.
Каково определение аббревиатуры GTZ в медицине?
Сокращение GTZ — «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».
Какая полная форма аббревиатуры GTZ?
Полная форма сокращения GTZ — «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».
Что означает GTZ в медицине?
Полное значение GTZ — «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».
Какое объяснение GTZ в медицине?
Обозначение для GTZ: «Gesellschaft Technische Zusammenarbeit».

Что означает аббревиатура GTZ в астрологии?

Сайт не только включает значения аббревиатуры GTZ в медицине. Да, мы знаем, что ваша основная цель — объяснение аббревиатуры GTZ в медицине.Однако мы подумали, что помимо значения определений GTZ в медицине, вы можете рассмотреть астрологическую информацию аббревиатуры GTZ в астрологии. Поэтому также включено астрологическое объяснение каждого слова в каждом сокращении GTZ.

GTZ Аббревиатура в астрологии

GTZ (буква G)
Вы привередливы, ищете совершенства внутри себя и своего возлюбленного. Вы отвечаете любовнику, который равен или превосходит вас по интеллекту и может повысить ваш статус.Вы чувственны и знаете, как достичь пика возбуждения, потому что вы работаете над этим кропотливо. Вы можете быть чрезвычайно активными, никогда не утомляться. Ваши обязанности и ответственность важнее всего остального. Возможно, вам трудно эмоционально сблизиться с людьми.
GTZ (буква T)
Вы очень чувствительны, скрытны и сексуально пассивны; вам нравится партнер, который берет на себя инициативу. Музыка, мягкий свет и романтические мысли заводят вас. Вы фантазируете, но не можете легко влюбиться и разлюбить.В любви вы романтичны, идеалистичны, мягки и чрезвычайно сильны. Вам нравится, когда ваши чувства и чувства стимулируются, возбуждаются и дразнят. Ты отличный флирт. Вы можете привести свои отношения в соответствие с вашей мечтой, зачастую все это происходит в вашей голове.
GTZ (буква Z)
Вы индивидуалистичны и вам нужна свобода, пространство и азарт. Вы романтичны, идеалистичны, часто влюблены в саму любовь, а не видите своего партнера такой, какая она есть на самом деле.Однако физическая привлекательность для вас не очень важна. Вы должны доказать, что достойны партнера. Вы часто эгоистичны, думая, что всегда правы, несмотря ни на что. Вы никогда не уступаете. Победа — ваше главное желание любой ценой. Вы часто забываете друзей и семью и живете настоящим моментом.

Deutsche Gesellschaft für Technische Zusammenarbeit (GTZ) GmbH

Федеральное предприятие Deutsche Gesellschaft für Technische Zusammenarbeit (GTZ) GmbH, являющееся предприятием международного сотрудничества в области устойчивого развития с мировыми операциями, поддерживает правительство Германии в достижении целей политики развития.

GTZ — это федеральное предприятие, базирующееся в Эшборне недалеко от Франкфурта-на-Майне. Основана в 1975 году как частно-правовая компания. Федеральное министерство экономического сотрудничества и развития Германии (BMZ) является его основным клиентом. Компания также действует от имени других министерств Германии, правительств других стран и международных клиентов, таких как Европейская комиссия, Организация Объединенных Наций и Всемирный банк, а также от имени частных предприятий. GTZ работает на общественных началах.Все полученные излишки направляются обратно в собственные проекты международного сотрудничества в целях устойчивого развития.

Проблема корпоративной социальной ответственности (КСО) — некогда особая область для специалистов по деловой этике — сегодня стоит на повестке дня предприятий, министерств и международных организаций. Принятие социальной и экологической ответственности все чаще признается в качестве основы устойчивого корпоративного управления: то есть КСО не как благотворительность, а как стратегическое конкурентное преимущество.

Центральным аргументом в пользу КСО является, помимо этических соображений, «деловой аргумент» — повышение уровня корпоративной экономической эффективности за счет социально и экологически устойчивой корпоративной политики.

Есть много преимуществ: упреждающее предотвращение рисков, инвестиции в будущее и хорошая репутация среди сотрудников, клиентов, инвесторов, политиков и общественности. Кроме того, стратегии КСО часто сопровождаются повышением качества и производительности.

Для GTZ корпоративная социальная ответственность является важным вопросом, потому что спектр ответственной и устойчивой корпоративной политики включает ряд областей, относящихся к политике развития:

— гарантии прав человека
— внедрение социальных стандартов
— профилактика ВИЧ / СПИДа / СПИДа
— сертификация поставщиков
— безопасность на рабочем месте
— защита потребителей
— защита климата
— забота об окружающей среде и
— экологическая управление природными ресурсами

GTZ и BMZ совместно финансируют проект по расширению охвата гендерных вопросов в отчетности по устойчивому развитию путем налаживания диалога по этой проблеме и определения способов улучшения ее охвата в Глобальной инициативе по отчетности.Этот диалог состоится в ходе ряда консультативных семинаров с участием многих заинтересованных сторон.

Проект, который совместно реализуется IFC и The Global Reporting Initiative при дополнительном финансировании со стороны правительств Исландии и Швейцарии, инициирует процесс, который — как часть более широкого проекта — приведет к разработке Документа по гендерным ресурсам, который будет поддерживать будущие экспертные группы, работающие над уточнением показателей эффективности GRI для следующего поколения Руководств и разработкой отраслевых приложений.

http://www.gtz.de/en/

gtz — английское определение, грамматика, произношение, синонимы и примеры

Содействие социальным программам (здравоохранение, образование, гидроэнергетика и др.) Из Франции, Италии, Японии, Кувейта, Саудовской Аравии, Нидерландов, Агентства Германии по техническому сотрудничеству ( GTZ ), Всемирного банка и Тайваня; а также неправительственные организации, в том числе Plan International, бюджет которой составляет около # млрд, Aide et Action, WE, Фонд Поля Жерен-Лажуа, который планирует инвестировать более # млн канадских долларов в год в течение следующих пяти лет в регион Сент-Луис, ENDA Tiers Monde, Vision Mondiale и Caritas Senegal

MultiUn

В апреле 2008 года правительство Германии (в тесном сотрудничестве с Германским отделом технического сотрудничества ( GTZ ) и Боннским международным центром конверсии (BICC) и Подразделением по стрелковому оружию Экономического сообщества западноафриканских государств (Ecowas)) поддержало семинар экспертов, который прошел в Международном центре подготовки миротворцев им. Кофи Аннана (KAIPTC) в Аккре, Гана.

ЕврЛекс-2

В качестве примера можно привести компонент ВИЧ / СПИДа PSV / DHTE / FE GTZ в Восточном и Юго-западном регионах.

MultiUn

Проект обучения базовым навыкам, 1995-2001 гг., С Немецким агентством технического сотрудничества ( GTZ ).

UN-2

В 1998 году GTZ в сотрудничестве с ВОЗ и ЮНИСЕФ начали работу по ведению больных с детскими заболеваниями (20 миллионов FMG на подготовку инструкторов в июле 1998 года).

UN-2

Многие страны также получают техническую или финансовую помощь от национальных агентств по сотрудничеству и развитию: Агентства международного сотрудничества (AECI) (Испания), GTZ (Германия), Бельгийского, Ирландского, Агентства США по международному развитию (USAID), Канадское агентство международного развития (CIDA), Зеленый фонд Канады, Новая Зеландия или международные финансовые агентства или организации: Межамериканский банк, Всемирный банк, Европейский союз, Африканский банк развития, Азиатский банк развития, Глобальный экологический фонд, так далее

MultiUn

В целях укрепления потенциала женщин как миротворцев ЮНИФЕМ совместно с Deutsche Gesellschaft für Technische Zusammenarbeit ( GTZ ) разработал базу данных с разбивкой по полу о демобилизации и реинтеграции бывших ополченцев и их иждивенцев на северо-западе Сомали.

UN-2

В 2004 году Немецкое агентство помощи GTZ провело семинар по процедурам справедливого судебного разбирательства для 50 адвокатов.

UN-2

Кроме того, возросшая известность инициативы Гран Чако означала, что партнерские отношения, которые уже были установлены с местными органами власти и сообществами, НПО, общественными организациями, IFAD, GTZ , Испания, ПРООН, ЮНЕП, были укреплены. Оценка региональной институциональной структуры привела к формулированию предложения ГЭФ PDF-A в сотрудничестве с ЮНЕП.

MultiUn

ФАО и Немецкое агентство по техническому сотрудничеству, GTZ , в конце девяностых создали партнерство для разработки версии программного обеспечения для Windows.

Обычное сканирование

В рамках GTZ APRN провела периодические оценки ДССБ в различных африканских странах и опубликовала результаты.

Обычное сканирование

В Бразилии проект по установлению связей UNCTAD- GTZ в Бразилии с привлечением # s и некоторых # s также дал заметные результаты.

MultiUn

В субрегионе Центральной Азии ГМ выступил инициатором Соглашения о стратегическом партнерстве (SPA), объединяющего АБР (через его #), CIDA и GTZ / CCD

MultiUn

В области альтернативных источников средств к существованию Европейская комиссия, Немецкое агентство по техническому сотрудничеству ( GTZ ) и УНП ООН сосредоточили внимание на усилиях по борьбе с наркотиками в Азии и Латинской Америке с целью обмена опытом о том, как повысить понимание и продвигать альтернативные методы. развитие в качестве национального приоритета развития в отдельных областях, в том числе в Центральной Азии

MultiUn

Он осуществляется при поддержке сотрудничества Германии ( GTZ ), частных предприятий и профсоюзов.

UN-2

ООН-Хабитат имеет донорскую поддержку со стороны USAID, Swiss Aid и GTZ .

Гига-френ

Составление бюджета с учетом гендерных факторов расширяется или воспроизводится ПРООН, ЮНИСЕФ и GTZ в Марокко и Колумбии.

UN-2

GTZ , ВОЗ и сети секс-работников обмениваются информацией и извлеченными уроками

КТО

Большой проект «Борьба с торговлей людьми из / в Афганистан» на сумму 9 евро.5 миллионов (1-я и 2-я фаза) были подписаны с GtZ от имени консорциума, включающего государства-члены ЕС, УНП ООН и Интерпол, в декабре 2008 года.

ЕврЛекс-2

GTZ предлагает широкий спектр услуг, адаптированных к конкретным политическим и социально-культурным условиям в странах-партнерах.

Обычное сканирование

Получившийся в результате продукт под названием 550 GTZ был выпущен ограниченным тиражом в пять единиц и основан на 550 Barchetta Pininfarina.

WikiMatrix

Цель 1, задача 2 (совместно с Cooperazione Internazionale, GTZ и CARE International в Йемене): (а) обучение сельских женщин и расширение их возможностей для управления проектами, приносящими доход; (б) реализация стратегии сокращения бедности; (в) повышение доходов бедных семей — в проект было вовлечено 30 000 семей и отдельных лиц; (г) создание женщин-предпринимателей и их регистрация в торговой палате; и (e) увеличение количества приносящих доход проектов для семей и отдельных лиц.

UN-2

Аналогичным образом, Тихоокеанский подготовительный семинар к восьмой сессии Форума запланирован на март 2009 года Секретариатом Тихоокеанского сообщества при поддержке Deutsche Gesellschaft für Technische Zusammenarbeit ( GTZ ), чтобы подготовиться к участию тихоокеанских островных стран и территорий в восьмой сессии.

UN-2

Справочник адресован в основном детям и в настоящее время переведен на семь местных языков при поддержке Немецкой организации технического сотрудничества ( GTZ ) (через SV / DHTE / FE).

UN-2

ГТЦ работает для большого количества клиентов и финансовых организаций.

Обычное сканирование

Deutsche Gesellschaft für Internationale Zusammenarbeit (GIZ) GmbH

Dag-Hammarskjöld-Weg 1-5
65760 Эшборн
Германия

GIZ — это федеральное предприятие, которое поддерживает правительство Германии в достижении его целей в области международного сотрудничества в целях устойчивого развития.Она работает более чем в 130 странах, в ней работает 17 000 сотрудников по всему миру. GIZ была создана в январе 2011 года путем слияния Германской службы развития (DED), Германской службы технического сотрудничества (GTZ) и Международной организации по наращиванию потенциала, Германия (InWEnt).

GIZ работает во многих секторах, включая экономическое развитие и занятость; управление и демократия; безопасность, восстановление, миростроительство и трансформация гражданских конфликтов; продовольственная безопасность, здоровье, базовое образование; и охрана окружающей среды, сохранение ресурсов и смягчение последствий изменения климата.В кризисных ситуациях GIZ реализует программы помощи беженцам и экстренной помощи.

Деятельность GIZ по предотвращению насилия сосредоточена в сфере межличностного и коллективного насилия. Большинство мероприятий в области межличностного насилия связано с предотвращением насилия среди молодежи и насилия в отношении женщин. GIZ устраняет последствия коллективного насилия с помощью подходов к социальной сплоченности и правосудию переходного периода, путем демобилизации вооруженных групп и продвижения согласованных на международном уровне договоров о правах человека.Он поддерживает многосекторальный подход к предотвращению насилия и направлен на борьбу с насилием на разных этапах жизненного цикла.

GIZ, например, реализует проекты в области предотвращения насилия среди молодежи в Сальвадоре, Либерии, Южной Африке и Тиморе-Лешти. Для информирования при разработке политики и планировании программ в рамках отраслевого проекта «Осуществление прав детей и молодежи» было разработано руководство «Системное предотвращение насилия среди молодежи» (http://www2.gtz.de/dokumente/bib-2011/giz2011-0105en). -профилактика-молодежь-насилие.pdf, доступен на английском, испанском, немецком).

Насилие в отношении женщин рассматривается совместно различными подразделениями GIZ. В разделе здравоохранения основное внимание уделяется предоставлению комплексных услуг по уходу, интегрированных в программы по ВИЧ / СПИДу и сексуальному и репродуктивному здоровью, с использованием подхода к ведению пациентов. В настоящее время он осуществляет программы в Демократической Республике Конго, в Руанде и Кении.

Деятельность сектора здравоохранения дополняется несколькими программами управления, направленными на сокращение повторного насилия среди правонарушителей посредством расширения доступа к правосудию для переживших бытовое и сексуальное насилие и защиты прав женщин, например, в Кении, Афганистане и Колумбии.Региональная программа, охватывающая Перу, Эквадор, Боливию и Парагвай, направлена на борьбу с насилием в отношении женщин посредством поддержки реализации национальной политики и планов действий и посредством партнерства с предприятиями частного сектора. С 1999 года GIZ также реализует региональный проект, направленный на прекращение калечащих операций на женских половых органах.

Координатор VPA

Д-р Питер Шмитц
Департамент: здравоохранения, образования, социальной защиты
Тел: +49 — 228 — 24 34 220
Электронная почта: [адрес электронной почты защищен]

Д-р Петер Шмитц — врач, специализирующийся в области хирургии и общественного здравоохранения.Перед медицинским образованием он получил квалификацию в области экологии и гигиены и имеет диплом в области здравоохранения и менеджмента в тропических странах. После нескольких краткосрочных заданий по оказанию гуманитарной помощи, начатой в 1982 году, он работал в Немецкой службе развития (DED) в Намибии в качестве регионального врача Министерства здравоохранения до 1999 года. С 2000 по 2009 год он был главным врачом Malteser International. . Его основная функция заключалась в стратегическом планировании гуманитарной помощи и структурного развития в постконфликтных ситуациях и после стихийных бедствий.Сюда входят услуги первичной медико-санитарной помощи, водоотведение и гигиена, ВИЧ / СПИД, психосоциальная помощь, гендерное насилие, средства к существованию и программы реабилитации. Он имеет обширный опыт преподавания и обучения в области гуманитарной помощи, международного здравоохранения, ВИЧ / СПИДа и управления проектами. В мае 2009 года он был назначен руководителем программ здравоохранения и медицинских служб бывшего DED, ныне GIZ в Бонне.

Координаторы молодежного насилия: Анна Рау и д-р Тина Зильбернагл ([адрес электронной почты защищен])
Координатор КОЖПО: д-р Габриэле Ган ([адрес электронной почты])

Германское агентство технического сотрудничества (GTZ) будет постоянно оказывать техническую и гуманитарную помощь афганским беженцам — Афганистан

Пешавар (14 ноября 2001 г.): немецкий Агентство технического сотрудничества (GTZ) предоставляет базовое образование для Афганские беженцы в рамках двустороннего проекта BEFARe (Базовое образование для Афганские беженцы).BEFARe работает на условиях технического сотрудничества. между Правительством Исламской Республики Пакистан и Федеральным Республика Германия.

Проект активен в области формального образования. и секторы неформального образования афганских беженцев. Формальное образование Программа в настоящее время отвечает за реализацию 301 первичного школы для 110 000 детей афганских беженцев в СЗПП. Неформальный Образовательная программа имеет дело с грамотностью (мужчины, женщины), вне школы, Домашние школы (для мальчиков, девочек) и Программа охраны здоровья матери и ребенка (MCH) для Афганских женщин и в настоящее время охватывает около 15 000 участников в эта программа.

Проект BEFARe, в рамках которого ценная помощь афганским беженцам в СЗПП за последние 12 лет будет продолжают играть еще более важную роль в ситуации, поскольку эти уязвимые Афганские беженцы нуждаются в дополнительной помощи и поддержке со стороны международного сообщества. Таким образом, GTZ-BEFARe будет играть решающую роль в оказании чрезвычайной помощи. новым афганским беженцам при экстренной помощи донора сообщество.

Проект оказывает помощь афганских беженцев за счет финансирования от различных международных агентств как УВКБ ООН, Всемирный банк, DFID.GTZ — ведущее агентство в сфере образования сектор для афганских беженцев и имеет обширные знания и опыт работы с ситуацией афганских беженцев. Предложения по дополнительной помощи к афганским беженцам также были переданы в различные международные агентства по оказанию помощи, и поэтому проект рассчитывает получить дополнительную помощь в рамках программы оказания чрезвычайной помощи и помощи правительства Германии и других международные донорские агентства в течение следующих нескольких месяцев. Это стремление проекта по сокращению страданий и трудностей афганских беженцев посредством предоставления такой гуманитарной помощи, как жилье, еда, вода и т. д.афганским беженцам в СЗПП.

Аналогично обязанности проект по оказанию помощи афганским беженцам будет расти в будущем и ожидается, что проект будет продлен после 2002 года и Правительство Германии продолжит оказывать поддержку афганским беженцам через ГТЦ.

8 Tatara Road Rahatabad, Пешавар-ПАКИСТАН. UPO BOX: 1481, тел .: 0092-91-840631 / 42955 Факс: 0092-91-841047 Эл. Почта: [email protected]., [email protected]

Genetalks / gtz: Компрессор с высокой производительностью и степенью сжатия для геномных данных на базе GTXLab Genetalks.

中文说明.

QQ группы: 934492381

WeChat группы:

На базе GTXLab Genetalks.

Индекс

Что такое GTX.Zip？

GTX.Zip (сокращенно GTZ) — это высокопроизводительный инструмент сжатия без потерь для произвольные файлы и имеет особенно высокую степень сжатия генетических данных, которые могут сжать FASTQ до 2% (почти 1/6 ~ 1/8 от fastq.gz) исходного размера даже при скорость 1100 МБ / с для файла fastq. GTX.Zip также поддерживает повторное сжатие файла fastq.gz напрямую.

-Назад к началу-

Серия продуктов

Продукт	Версия	Описание	Как получить
GTX.Zip Professional	V3.0.0	Компании, учреждения и отдельные пользователи, у которых есть большие локальные данные секвенирования	Установить
GTX.Почтовый индекс Enterprise	V1.0.1	Крупные предприятия и центры обработки данных, которые используют данные секвенирования на уровне PB и требуют распределенного сжатия с помощью собственных вычислительных кластеров	Свяжитесь с нами
GTX.Zip Cloud	V1.0.1	Компании, которые занимаются распределением и хранением больших объемов данных секвенирования в облаке	http://gtz.io

-В начало-

Поддерживаемое программное обеспечение для биоинформатического анализа

BWA 0.7 для GTX.Zip — это наиболее широко используемый программный пакет для картирования последовательностей ДНК, которые могут напрямую вводить файл XXX.gtz. Он состоит из двух программ: bwa 0.7 и bwa-opt 0.7.
- bwa-opt 0.7 — это оптимизированная версия, которая примерно на 30% быстрее, чем стандартный bwa, и ее результаты сопоставления полностью соответствуют результатам стандартного bwa.
BOWTIE / BOWTIE2 для GTX.Zip — это сверхбыстрый и эффективный с точки зрения памяти инструмент для совмещения считываний секвенирования с длинными контрольными последовательностями.Он может напрямую вводить файл XXX.gtz, и вы можете использовать этот инструмент, как если бы вы использовали официальную версию.
- BOWTIE для GTX.Zip на основе версии BOWTIE 1.2.2.
- BOWTIE2 для GTX.Zip на основе версии BOWTIE2 2.3.4.3.

-В начало-

Элемент

Характеристики компрессорной системы GTX.Zip:

Высокая степень сжатия : В системе реализована технология сжатия контекстной модели с множеством оптимизированных моделей прогнозирования и балансировка одновременного использования системы и ресурсов памяти, что позволяет достичь чрезвычайно высокой степени сжатия.Для файлов FASTQ GTX.Zip может сжать исходный файл fastq до 2,53%. Степень сжатия GTX.Zip примерно в 3-6 раз выше, чем у сжатия gzip, что может сэкономить до 80% места для хранения и затрат на передачу.

Список данных	Степень сжатия GTX.Zip	Степень сжатия Fastq.gz
Nova_wes_1.fq	2,53%	17,15%
Nova_wes_2.fq	3.45%	18,34%
nova_wgs_1.fq	3,18%	17,55%
nova_wgs_2.fq	3,93%	18,66%
nova_rna_1.fq	4,56%	17,70%
nova_rna_2.fq	5,39%	18,94%

High Performance : GTX.Zip полностью использует параллелизм ЦП, новую архитектуру ЦП Haswell и вычислительную мощность новых инструкций, таких как AVX2, BMI2, что делает GTX.Zip получает высокую скорость сжатия даже на обычном вычислительном сервере с пропускной способностью 1100 МБ / с для одного узла сжатия. GTX.Zip Enterprise поддерживает крупномасштабное распределенное сжатие.
Гарантия безопасности : Благодаря высокой скорости в процессе сжатия GTX.Zip выполняется проверка распаковки и восстановления данных. Процесс сжатия будет выполнен только после того, как данные будут подтверждены точно так же, как исходные данные. Проверка MD5 также выполняется для обеспечения целостности данных.
Software Ecology : GTX.Zip предоставляет программное обеспечение для декомпрессии из командной строки и графического интерфейса пользователя для Linux, Mac OSX и Windows. Он также предоставляет интерфейсы SDK на таких языках, как Python, C, C ++ и т. Д., Что позволяет сторонним разработчикам напрямую читать и записывать файл gtz (формат сжатия GTX.Zip). Например, gtz-версия bcl2fastq, fastp и BWA теперь поддерживаются сообществом.
Если вы хотите получить это программное обеспечение, перейдите на -GTZ Ecology Softwares-.
Nirvana Plan :
В качестве программного обеспечения корпоративного уровня GTX.Zip разработала программу nirvana для требований высокой доступности, чтобы пользователи могли распаковывать сжатые данные в исходные данные в экстремальных условиях. Стратегия защиты двойной доступности плана nirvana выглядит следующим образом:
- GTX.Zip размещен на нескольких сайтах. Веб-сайт http://gtz.io, GitHub и другие сайты будут постоянно размещать все версии GTX.Zip, чтобы обеспечить его постоянную и бесплатную доступность для всей сети.
- Чтобы гарантировать, что сжатые данные могут быть восстановлены в исходный файл при любых условиях, предварительно встроенные программы микродекомпрессии могут быть сначала извлечены из сжатых данных, а затем использованы для распаковки файла.
- Щелкните -здесь- для использования.

-В начало-

Требования к системной среде

64-разрядная система Linux (CentOS> = 6.1 ； Ubuntu> = 12.04 ， <18.04)
В операционной системе Linux для достижения хорошей производительности рекомендуется вычислительный сервер с 32-ядерным 64 ГБ памяти или имеющий такую же конфигурацию с AWS C4.8xlarge машина)
64-битная система Windows (Win7, Win10)

Как установить （Linux)

Режим 1: установка непосредственно из командной строки (рекомендуемый метод установки)

Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:

sudo curl -SL https://gtz.io/gtz_latest.run -o /tmp/gtz.run && sudo sh /tmp/gtz.run

После установки исполняемый файл GTZ и файл лицензии помещаются в каталог / usr / local / GTZ, мягкая ссылка GTZ создается в / usr / bin

Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:

curl -SL https: // gtz.io / gtz_latest.run -o /tmp/gtz.run && sh /tmp/gtz.run && source ~ / .bashrc

После установки исполняемый файл GTZ и файл лицензии помещаются в папку текущего пользователя. Каталог ~ / .config / GTZ, псевдоним GTZ добавляется в ~ / .bashrc

Режим 2: сначала загрузите программное обеспечение, а затем установите его.

Сначала загрузите программное обеспечение с -GTX.Zip Professional-.

Коммерчески авторизованные пользователи обращаются по адресу [email protected].

Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:

судо sh gtz_latest.бег

Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:

sh gtz_latest.run && source ~ / .bashrc

После установки исполняемый файл GTZ и файл лицензии помещаются в каталог ~ / .config / GTZ текущего пользователя, псевдоним GTZ добавляется в ~ / .bashrc

Убедитесь, что установка прошла успешно

При выполнении следующей команды появляется соответствующая информация о версии программного обеспечения, указывающая, что установка прошла успешно

gtz - версия

Как установить （Windows)

Установить
Ссылки для скачивания установочного пакета https: // gtz.io / gtz-2.1.4-x64-setup.exe
Дважды щелкните файл gtz-X.X.X-x64-setup.exe, чтобы начать установку ：
Выберите каталог для установки ：
Выберите «Да», чтобы завершить настройку переменной среды PATH, затем вы можете выполнить программу gtz по любому пути ：
Установка завершена ：
После завершения установки откройте командное окно cmd, чтобы узнать, успешно ли она установлена; и используйте его, введя в командной строке:
Удалить
Откройте контекстное меню системы Windows и выберите Удалить GTZ ：
Или войдите в каталог установки ， запустите Uninstall GTX.exe ：

Как установить （MacOS)

Установить
Ссылки для скачивания установочного пакета https://gtz.io/gtz-2.1.4-x64-setup.pkg
Дважды щелкните файл gtz-2.1.4-x64-setup.pkg, чтобы начать установку ：
Выберите «Продолжить» ：
Выберите «Продолжить» ：
Выберите «Согласен» ：
Выберите «Установить», затем введите свое имя пользователя и пароль, нажмите «Установить программное обеспечение»:
Установка прошла успешно, нажмите «Закрыть» ：
Убедитесь, что установка прошла успешно
Откройте терминал и выполните следующую команду.Если отображается соответствующая информация о версии программного обеспечения, установка прошла успешно. После успешной установки вы можете использовать программу gtz через командную строку в терминале:

-В начало-

Быстрый старт (Linux)

На текущий компьютер необходимо установить

GTX.Zip Professional. Если нет, см. -Как установить-.

1. Загрузите файл образцов для сжатия
Загрузка образца: -sample.fq-

* 2 ГБ файл fastq, извлеченный из реальных данных WES, созданных Novaseq

Эталонный геном Загрузить: -GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna.gz-

2. Начать сжатие

гтз sample.fq --ref GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna.gz

* gtz также может напрямую сжимать файл fastq.gz

3 、 распаковать

gtz -d sample.fq.gtz

Быстрый старт (Windows)

GTX.Zip Professional необходимо установить на текущий компьютер. Если нет, см. -Как установить-.

1. Загрузите файл образцов для сжатия
Загрузка образца: -sample.fq-

* 2 ГБ файл fastq, извлеченный из реальных данных WES, созданных Novaseq

Эталонный геном Загрузить: -GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna.gz-

2. Откройте командное окно Windows
gtz --version

3.Начать сжатие

гтз sample.fq --ref GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna.gz

* gtz также может напрямую сжимать файл fastq.gz

4 、 распаковать

gtz -d sample.fq.gtz

Как использовать

Командная навигация:

Пример использования:

1. Сжатие fastq / fastq.gz (сжатие высокой мощности)

1.1 Режим сжатия по умолчанию для fastq

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna(.gz)

Параметр ref используется для указания файла fasta эталонного генома для соответствующего вида nova.fastq.gz, а файл fasta также поддерживает формат gz. Примечание: после сжатия файл fasta больше не нужен при распаковке.

1.2 Режим сжатия по умолчанию для bam

gtz /data/nova.bam --ref /fasta/genomic.fna(.gz)

Параметр ref используется для указания файла fasta эталонного генома для новой.бац соответствующий вид, и это необходимо. После сжатия, а файл fasta при распаковке больше не нужен.

1.3 Укажите имя выходного файла

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna -o /out/nova.gtz

-o параметр определяет имя выходного файла, обратите внимание, что строчная буква o

1.4 Декомпрессия и проверка после завершения сжатия

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna --verify

После завершения сжатия данных GTX.Zip снова распакует его, чтобы проверить данные MD5 и убедиться, что данные могут быть полностью восстановлены. Если сжатый файл используется для архивирования, рекомендуется добавить этот параметр проверки. В мирное время этот параметр добавлять не нужно.

1,5 Быстрое сжатие

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna -l 1

-l Параметрический уровень сжатия. 1-5 — это режим быстрого сжатия. Текущий алгоритм сжатия, используемый в 1-5, тот же, здесь в основном для будущего расширения.Тот же алгоритм сжатия, что и в 6-9, который также предназначен для дальнейшего расширения. 6 — это уровень сжатия по умолчанию, то есть самый высокий алгоритм сжатия.

1,6 Предельная обжатая резьба

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna -p 4

Параметр -p указывает количество потоков, используемых для сжатия. Здесь -p 4 означает, что во всем процессе сжатия будут использоваться только 4 потока, что очень полезно при нехватке вычислительных ресурсов.

1.7 Измените путь кэша по умолчанию

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna --cache-path / path / cache /

При использовании — ref для указания fasta, GTZ конвертирует FASTA в соответствующий двоичный файл и кэширует его по пути по умолчанию (/ home / user /. Config / gtz), так что, когда тот же самый FASTA указан для следующего сжатия, GTZ может считывать данные прямо из пути кэширования, что относительно быстро. Вы можете использовать этот параметр, если он вам нужен (например, / home / user не хватает места)

1.8 Не упаковывайте файлы fasta

gtz /data/nova.fastq.gz --ref /fasta/genomic.fna --donot-pack-ref

При использовании опции-donot-pack-ref результирующий целевой файл gtz меньше, но при разархивировании необходимо указать соответствующий файл fasta. Мы не рекомендуем использовать эту опцию, потому что без этой опции степень сжатия имеет небольшой эффект по сравнению с этой опцией, но если вы используете эту опцию, вам нужно указать соответствующий фаста при распаковке, и вы должны убедиться, что фаста правильно сохранена в безопасном месте. диск.

2. Обыкновенное сжатие

2.1 сжатие fastq / fastq.gz

гтз /data/nova.fastq.gz

Если для указания fasta не используется —ref, GTZ сжимает файл fastq как обычно, и в большинстве случаев степень сжатия при обычном сжатии намного ниже, чем при высоком сжатии.

2.2 Сжатие файлов non-fastq / fastq.gz

гтз /data/test.bam

GTZ может сжимать любой файл

3. Декомпрессия

3.1 Распакуйте файл fastq.gtz со сжатием FASTA без FASTA

gtz -d nova.fastq.gtz

Для распаковки файлов gtz со сжатием fasta по умолчанию файлы fasta не требуются, что является особенностью gtz2.x.x

3.2 Распакуйте файл bam.gtz со сжатием FASTA без FASTA

gtz -d nova.bam.gtz

gtz -d nova.bam.gtz --bam-to-sam

по умолчанию, bam.gtz распаковывается в bam, если вы хотите распаковать в sam, добавьте параметры —bam-to-sam

3.3 Разархивируйте файл gtz с помощью сжатия fasta. Нужно указать фасту

gtz -d nova.fastq.gtz --ref /fasta/genomic.fna(.gz)

Если сжатие принимает fasta и использует параметр-donot-pack-ref, вам необходимо указать fasta, который будет использоваться при распаковке.

3.3 Распаковать на терминал

gtz -d nova.fastq.gtz -c 2> / dev / null

Параметр

-C представляет собой декомпрессию для терминала. 2> / dev / null означает, что другие отпечатки удаляются и печатается только извлеченное содержимое fastq.

3.4 Распаковать по указанному пути

gtz -d nova.fastq.gtz -O / путь / выход /

-O параметр указывает выходной каталог распакованного файла. Обратите внимание, что заглавная буква O

3.5 Ограничение резьбы декомпрессии

gtz -d nova.fastq.gtz -p 4

Параметр -P также подходит для декомпрессии, здесь -P 4 означает, что для декомпрессии используются только четыре потока.

3.6 Распаковать gtz-файлы с низкой версией со сжатием bin

gtz -d nova.fastq.old.gtz -r Homo_sapiens_bcacac

31276504f27c6cf40e580.rbin

Параметр -r используется для совместимости с версией GTZ, которая ниже 2.0.0. Версия 2.0 может сжимать любой файл GTZ в старой версии. Когда старая версия GTZ сжимает текст fastq и использует параметр -b для указания соответствующего файла bin, тогда версия 2.0.0 может использовать -r для указания соответствующего файла RBIN для распаковки старой версии файла GTZ.

Описание параметра:

  --ref <строка>
@ compress: указывает Fasta, соответствующий сжатому файлу,
что приводит к более высокой степени сжатия

@ декомпрессия: если сжатие использует Fasta и параметр
--donot-pack-ref, соответствующий Fasta должен быть
указывается этим параметром при распаковке

--бэм-к-Сэму
     @ compress: не использовать

     @ decopress: распаковать bam to sam, это действительно только для BAM,
     в противном случае бам распаковать до бац

-z, --fastq-to-fastq-gz
@ compress: не использовать

@ распаковать: распаковать fastq в fastq.gz, это действительно только для
FASTQ

--cache-path <строка>
@ compress: если Fasta указан параметром --ref, GTZ преобразует Fasta
в соответствующий двоичный файл, а затем кэширует его по умолчанию
путь, так что когда для сжатия указан тот же Fasta, GTZ
может считывать данные напрямую из пути кэширования, что относительно быстро.
путь кеша по умолчанию - /home/xuxl/.config/gtz, вы можете использовать это
параметр для его изменения

@ декомпрессия: то же самое, что и сжатие

--donot-pack-ref
@ compress: этот параметр не рекомендуется.По умолчанию, когда
сжатие использует Fasta, GTZ извлекает данные из Fasta, а затем
сжимает его в файл GTZ, так что результирующий файл GTZ не
дольше требуется фаста при распаковке. использовать эту опцию или нет,
степень сжатия оказывает незначительное влияние, но если вы воспользуетесь этой опцией, вы
нужно указать соответствующую фасту при распаковке

@ декомпрессия: не использовать

--проверять
@ compress: после сжатия данных распаковать сгенерированный файл GTZ
еще раз, чтобы убедиться, что сгенерированный файл GTZ нужно распаковать.Обычно в этом нет необходимости, но если он используется для архивирования, вы можете
используйте этот параметр.

@ декомпрессия: не использовать

-l <число>, --level <число>
@ compress: [1-5] - режим быстрого сжатия, в настоящее время сжатие 1-5
алгоритм такой же, вот для дальнейшего расширения. 6 по умолчанию. [6-9] - это
лучший уровень сжатия, алгоритм сжатия тоже такой же, вот
для последующего расширения

@ декомпрессия: когда gtz в формате FASTQ распаковывается в
        fastq.gz, степень сжатия gz можно изменить с помощью -l / - level,
        от 0 до 9, уровень по умолчанию - 4

-r <строка>, --rbin-path <строка>
@ compress: не использовать

@ декомпрессия: использовать только для версии ниже 2.0.0, в основном для
совместимость со старыми версиями. когда сжатие указывает BIN
файл, вы можете использовать этот параметр, чтобы указать соответствующий RBIN
файл или каталог, в котором находится файл RBIN,
распаковать.

-O <строка>, --out-dir <строка>
@ compress: не использовать

@ декомпрессия: укажите каталог для сохранения файла распаковки

-f, --force
@ compress: принудительная перезапись выходного файла

@ декомпрессия: то же самое, что и сжатие

-c, --stdout
@ compress: не использовать

@ декомпрессия: вывод декомпрессии на терминал

-d, --decompress
@ compress: не использовать

@ декомпрессия: укажите файл GTZ для распаковки

-p <число>, --parallel <число>
@ compress: укажите параллельный номер, по умолчанию - логические ядра ЦП

@ декомпрессия: то же самое, что и сжатие

-o <строка>, --out <строка>
@ compress: укажите имя выходного файла GTZ

@ декомпрессия: не использовать

-e, --no-keep
@ compress: не сохранять входные файлы

@ декомпрессия: не использовать

--версия
Отображает информацию о версии и завершает работу.-h, --help
Отображает информацию об использовании и завершает работу.

<имя файла>
имя входного файла

Лабораторный компрессор GTX

-Назад к началу-

Программное обеспечение для экологии

1 、 BWA для GTZ (поддержка версии gtz 2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка непосредственно из командной строки (рекомендуемый метод установки)
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
sudo curl -SL https://gtz.io/bwagtz_latest.run -o / tmp / bwagtz.запустить && sudo sh /tmp/bwagtz.run
После установки исполняемые файлы bwa-gtz и bwa-opt-gtz помещаются в каталог / usr / local / bwa-gtz, программные ссылки bwa-gtz и bwa-opt-gtz создаются в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
curl -SL https://gtz.io/bwagtz_latest.run -o /tmp/bwagtz.run && sh /tmp/bwagtz.run && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bwa-gtz и bwa-opt-gtz помещаются в ~ /.Каталог config / bwa-gtz, псевдонимы bwa-gtz и bwa-opt-gtz добавляются в ~ / .bashrc
Mode 2: Сначала загрузите программное обеспечение, а затем установите его.
Сначала загрузите программное обеспечение с -GTX.Zip Professional-.
Коммерчески авторизованные пользователи обращаются по адресу [email protected].
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
судо ш bwagtz_latest.run
После установки исполняемые файлы bwa-gtz и bwa-opt-gtz помещаются в каталог / usr / local / bwa-gtz, программные ссылки bwa-gtz и bwa-opt-gtz’2 создаются в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
sh bwagtz_latest.запустите && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bwa-gtz и bwa-opt-gtz помещаются в каталог ~ / .config / bwa-gtz текущего пользователя, псевдонимы bwa-gtz и bwa-opt-gtz добавляются в ~ / .bashrc
Как использовать?
Пакет поддержки
GTX.Zip для BWA включает bwa-gtz и bwa-opt-gtz, оба из которых основаны на версии 0.7.17 bwa. Среди них: в двух версиях добавлена возможность чтения файлов GTZ напрямую, а функции полностью соответствуют основным функциям кода bwa.bwa-opt-gtz также оптимизирует структуру таблицы поиска BWA, что позволяет сэкономить более трети времени без изменения результатов сравнения. Из-за некоторых изменений в структуре данных таблицы поиска, bwa-opt-gtz несовместима с данными индексного файла, сгенерированными исходным bwa. В соответствии со стандартными шагами bwa сначала заново сгенерируйте индексный файл, а затем сравните его с bwa-opt-gtz.
Разница между bwa-gtz и bwa-opt-gtz заключается в следующем:
(1) bwa-gtz может напрямую использовать индекс, созданный на официальном веб-сайте BWA, и его производительность соответствует показателям официального веб-сайта BWA.
(2) bwa-opt-gtz не может напрямую использовать индекс, созданный BWA на официальном сайте. index необходимо воспроизвести с помощью bwa-opt-gtz, но его производительность будет улучшена на 1/3, чем у BWA на официальном сайте.
Примеры использования
Шаг первый: пропустите этот шаг, если для распаковки read.gtz не требуется справочный файл, в противном случае укажите соответствующую ссылку следующим образом:
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin / (Подходит для версии gtx1.x.x, укажите путь к файлу rbin для распаковки, рекомендуется, но не требуется, если не указано, gtz загрузится автоматически, займет определенное время)
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / путь / fasta / xxx.fa (подходит для версии gtx2.x.x, указывает соответствующий файл fasta для распаковки, обязательно)
Шаг второй: сравнение выполнения
bwa-opt-gtz mem ref.fa read1.fq.gtz read2.fq.gtz -t 4 -o aln-pe.sam
bwa-opt-gtz
Шаг первый: переделать индекс (обязательно)
bwa-opt-gtz индекс ref.fa
Шаг второй: сравнение выполнения ， если для распаковки требуется указанный эталонный файл, обратитесь к bwa-gtz, используя пример первого шага
bwa-opt-gtz mem ref.fa read1.fq.gtz read2.fq.gtz -t 4 -o aln-pe.sam

производительность

При достаточных ресурсах сервера производительность bwa-opt-gtz на 1/3 лучше, чем у официального bwa. Ниже представлен набор тестовых данных в той же среде (количество указанных потоков — 4):

Тестовая команда

bwa mem ref.fa read1.fq.gz read2.fq.gz -t 4 -o aln-pe.sam

bwa-gtz mem ref.fa read1.fq.gtz read2.fq.gtz -t 4 -o aln-pe.sam

bwa-opt-gtz mem ref.fa read1.fq.gtz read2.fq.gtz -t 4 -o aln-pe.sam

Тестовая среда

Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: read1.fq.gz (1,8 ГБ), read2.fq.gz (1,8 ГБ), read1.fq.gtz (0,3 ГБ), read2.fq.gtz (0,3 ГБ)

рабочие характеристики

Программное обеспечение	bwa	bwa-gtz	bwa-opt-gtz
Расход времени	50м14.06с	51м 37.67с	39м 18,86с
Потребление памяти	5,888 г	10,56 г	19.84G

2 、 BCL2FASTQ для GTZ (поддержка GTZ 3.0.1)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https://gtz.io/bcl2fastq_gtz_latest.запустить -o /tmp/bcl2fastqgtz.run && sh /tmp/bcl2fastqgtz.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить bcl2fastq-gtz в любом каталоге
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip bcl2fastq-gtz- ， затем установите
sh bcl2fastq_gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти и снова войти в систему
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https: // gtz.io / bcl2fastq_gtz_latest.run -o /tmp/bcl2fastqgtz.run && sudo sh /tmp/bcl2fastqgtz.run
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip bcl2fastq-gtz- ， затем установите
sudo sh bcl2fastq_gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить bcl2fastq-gtz в любом каталоге
Как использовать?
Gtx. Пакет поддержки Zip для bcl2fastq, основанный на версии bcl2fastq v2.20.0.422.
Формат вывода gtz по умолчанию, формат вывода gz, когда команда использует параметр —no-bgtzf-сжатие
Пример 1. по умолчанию выходной файл результатов имеет формат gtz, использующий обычное сжатие (файл fastq, созданный с помощью bcl2fastq, не прошел контроль качества, поэтому мы можем попробовать использовать обычное сжатие, потому что эффект обычного сжатия может быть лучше, чем сжатие эталонного генома для файла fastq с низким качеством, которое можно выбрать после сравнения)
bcl2fastq-gtz -i./ data / BaseCalls -R ./outdir/run --interop-dir ./outdir/interop -o ./outdir/result --ignore-missing-bcls --ignore-missing-filter --ignore-missing-sizes - -barcode-mismatches 0 --use-base-mask y *, i7, i7, y *> ./ outdir / bcl2fastq.log 2> & 1 || коснитесь bcl2fastq.err
Пример 2. Выходной файл результата имеет формат gtz, перейдите к высокому сжатию, укажите файл Fasta с помощью —ref, также вы можете использовать —donot-pack-ref
bcl2fastq-gtz -i ./data/BaseCalls -R ./outdir/run --interop-dir./ outdir / interop -o ./outdir/result --ignore-missing-bcls --ignore-missing-filter --ignore-missing-позиции --barcode-mismatches 0 --use-base-mask y *, i7, i7, y * --ref /GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna.gz> ./ outdir / bcl2fastq.log 2> & 1 || коснитесь bcl2fastq.err
Пример 3. Выходной файл результата имеет формат gz, используйте параметр —no-bgtzf-compress
bcl2fastq-gtz -i ./data/BaseCalls -R ./outdir/run --interop-dir ./outdir/interop -o ./outdir/result --ignore-missing-bcls --ignore-missing-filter --ignore-missing-position --barcode-mismatches 0 --use-base-mask y *, i7, i7, y * --no-bgtzf-compress>./outdir/bcl2fastq.log 2> & 1 || коснитесь bcl2fastq.err
производительность
Тестовая команда
bcl2fastq -i ./data/BaseCalls -R ./outdir/run --interop-dir ./outdir/interop -o ./outdir/result --ignore-missing-bcls --ignore-missing-filter - ignore-missing-position --barcode-mismatches 0 --use-base-mask y *, i7, i7, y *> ./ outdir / bcl2fastq.log 2> & 1 || коснитесь bcl2fastq.err
bcl2fastq-gtz -i ./data/BaseCalls -R./ outdir / run --interop-dir ./outdir/interop -o ./outdir/result --ignore-missing-bcls --ignore-missing-filter --ignore-missing-position --barcode-mismatches 0 - use-base-mask y *, i7, i7, y *> ./ outdir / bcl2fastq.log 2> & 1 || коснитесь bcl2fastq.err
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: ./data/BaseCalls общий размер 40G
Рабочие характеристики
Папка назначения вывода bcl2fastq общий размер 40 ГБ ， Папка назначения вывода bcl2fastq-gtz общий размер 16 ГБ

3 、 STAR для GTZ (поддержка версии GTZ

<2.x.x)

Официальный сайт STAR напрямую поддерживает формат GTZ, после установки GTZ и STAR

Первый этап
сделать индексный файл со звездой
STAR --runMode genomeGenerate --genomeDir / path / to / genomeDir --genomeFastaFiles /path/xxx.fasta
Подробная ссылка на документы официального сайта:
https://github.com/alexdobin/STAR/blob/master/doc/STARmanual.pdf
Второй шаг
выполняет операцию сопоставления.пример следующим образом:
метод первый
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
STAR —genomeDir / path / to / genomeDir —readFilesIn read1.fq.gtz read2.fq.gtz —readFilesCommand gtz -c -d
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , что может ускорить обработку GTZ. Потому что, когда GTZ нужен файл RBIN и он не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ /.config / gtz, он будет загружен по сети, и процесс загрузки займет время.
метод два
STAR —genomeDir / путь / к / genomeDir —readFilesIn read1.fq.gtz read2.fq.gtz —readFilesCommand gtz -r / path / to / gtz_rbin_dir / -c -d
* В этом примере каталог, в котором находится файл RBIN, определяется параметром -r, он такой же, как и в первом методе.

4 、 BOWTIE для GTZ (поддержка версии gtz 2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка непосредственно из командной строки (рекомендуемый метод установки)
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
sudo curl -SL https: // gtz.io / bowtiegtz_latest.run -o /tmp/bowtiegtz.run && sudo sh /tmp/bowtiegtz.run
После установки исполняемые файлы bowtie-gtz и bowtie-build-gtz и bowtie-inspect-gtz помещаются в каталог / usr / local / bowtie-gtz, их программная ссылка создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
curl -SL https://gtz.io/bowtiegtz_latest.run -o /tmp/bowtiegtz.run && sh /tmp/bowtiegtz.run && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bowtie-gtz и bowtie-build-gtz и bowtie-inspect-gtz помещаются в ~ /.config / bowtie-gtz, их псевдоним добавлен в ~ / .bashrc
Mode 2: Сначала загрузите программное обеспечение, а затем установите его.
Сначала загрузите программное обеспечение с -GTX.Zip Professional-.
Коммерчески авторизованные пользователи обращаются по адресу [email protected].
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
судо sh bowtiegtz_latest.run
После установки исполняемые файлы bowtie-gtz и bowtie-build-gtz и bowtie-inspect-gtz помещаются в каталог / usr / local / bowtie-gtz, их программная ссылка создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
sh bowtiegtz_latest.запустите && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bowtie-gtz и bowtie-build-gtz и bowtie-inspect-gtz помещаются в каталог ~ / .config / bowtie-gtz текущего пользователя, их псевдоним добавляется в ~ / .bashrc
Как использовать?
После установки будут сгенерированы три исполняемые программы bowtie-gtz, bowtie-build-gtz и bowtie-inspect-gtz. Если при установке «создать программную ссылку на / usr / bin» выбрано y, указанная выше исполняемая программа может быть запущена непосредственно в любом каталоге; В противном случае вам нужно перейти в каталог установки и запустить с./ bowtie-gtz.
Пакет поддержки
GTX.Zip для Bowtie на основе версии 1.2.2. Bowtie-gtz может напрямую использовать индекс, созданный Bowtie на официальном сайте. Вы можете использовать bowtie-build или bowtie-build-gtz для создания индекса. Конечно, функции bowtie-inspect-gtz и bowtie-inspect абсолютно одинаковы.
Примеры использования
Шаг первый: сделайте индекс
Bowtie-build-gtz ref.fa ref_index
Шаг второй: сравнение выполнения
1) Пропустите этот шаг, если показывается декомпрессия.fq.gtz не требует справочного файла, в противном случае укажите соответствующую ссылку следующим образом:
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin / (Подходит для версии gtx1.x.x, укажите путь к файлу rbin для распаковки, рекомендуется, но не требуется, если не указано, gtz загрузится автоматически, займет определенное время)
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / fasta / xxx.fa (подходит для версии gtx2.x.x, указывает соответствующий файл fasta для распаковки, обязательно)
2) выполнение команды
bowtie-gtz -S ref_index читает.fq.gtz, например, sam
производительность

5 、 BOWTIE2 для GTZ (поддержка версии gtz 2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка непосредственно из командной строки (рекомендуемый метод установки)
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
sudo curl -SL https://gtz.io/bowtie2gtz_latest.run -o /tmp/bowtie2gtz.run && sudo sh /tmp/bowtie2gtz.run
После установки исполняемые файлы bowtie2-gtz и bowtie2-build-gtz и bowtie2-inspect-gtz помещаются в каталог / usr / local / bowtie2-gtz, их программная ссылка создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
curl -SL https: // gtz.io / bowtie2gtz_latest.run -o /tmp/bowtie2gtz.run && sh /tmp/bowtie2gtz.run && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bowtie2-gtz и bowtie2-build-gtz и bowtie2-inspect-gtz помещаются в каталог ~ / .config / bowtie2-gtz текущего пользователя, их псевдоним добавляется в ~ / .bashrc
Mode 2: Сначала загрузите программное обеспечение, а затем установите его.
Сначала загрузите программное обеспечение с -GTX.Zip Professional-.
Коммерчески авторизованные пользователи получают через contact @ gtz.io.
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
судо sh bowtie2gtz_latest.run
После установки исполняемые файлы bowtie2-gtz и bowtie2-build-gtz и bowtie2-inspect-gtz помещаются в каталог / usr / local / bowtie2-gtz, их программная ссылка создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
sh bowtie2gtz_latest.run && source ~ / .bashrc
После установки исполняемые файлы bowtie2-gtz и bowtie2-build-gtz и bowtie2-inspect-gtz помещаются в ~ /.config / bowtie2-gtz, их псевдоним добавлен в ~ / .bashrc
Как использовать?
После установки будут сгенерированы три исполняемые программы bowtie2-gtz, bowtie2-build-gtz и bowtie2-inspect-gtz. Если при установке «создать программную ссылку на / usr / bin» выбрано y, указанная выше исполняемая программа может быть запущена непосредственно в любом каталоге; В противном случае вам нужно перейти в каталог установки и запустить с ./bowtie2-gtz.
Пакет поддержки
GTX.Zip для bowtie2 на основе 2.Версия 3.4.3. Bowtie2-gtz может напрямую использовать индекс, созданный bowtie2 на официальном сайте. Вы можете использовать bowtie2-build или bowtie2-build-gtz для создания index. Конечно, функции bowtie2-inspect-gtz и bowtie2-inspect абсолютно одинаковы.
Примеры использования
Шаг первый: сделайте индекс
bowtie2-build-gtz ref.fa ref_index
Шаг второй: сравнение выполнения
1) Пропустите этот шаг, если для распаковки read1.fq.gtz и read2.fq.gtz не требуется файл ссылки, в противном случае укажите соответствующую ссылку следующим образом:
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin / (подходит для gtx1.x.x, укажите путь к файлу rbin для распаковки, рекомендуется, но не требуется, если не указано иное, gtz загрузится автоматически, на это потребуется определенное время)
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / fasta / xxx.fa (подходит для версии gtx2.x.x, указывает соответствующий файл fasta для распаковки, обязательно)
2) выполнение команды
bowtie2-gtz -x ref_index -1 reads_1.fq.gtz -2 reads_2.fq.gtz -S eg2.sam -p 4 --reorder

производительность

Тестовая команда

bowtie2 -x ref_index -1 reads_1.fq.gz -2 reads_2.fq.gz -S eg2.sam -p 4 --reorder

bowtie2-gtz -x ref_index -1 reads_1.fq.gtz -2 reads_2.fq.gtz -S eg2.sam -p 4 --reorder

Тестовая среда

Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: read1.fq.gz (1,55 ГБ), read2.fq.gz (1,78 ГБ), read1.fq.gtz (0,43 ГБ), read2.fq.gtz (0,61 ГБ)

рабочие характеристики

Программное обеспечение	галстук-бабочка2	bowtie2-gtz
Потребление ЦП (среднее)	400	445
Потребление памяти (среднее)	0.19G	12,92 г
Расход времени	63м41.06с	61м 56.67с

6 、 TOPHAT для GTZ (поддержка версии gtz

<2.x.x)

Как установить?
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https://gtz.io/tophatgtz_latest.run -o /tmp/tophatgtz.run && sudo sh /tmp/tophatgtz.run
или
скачать установочные файлы ： -GTX.Zip tophat-gtz-
Запускать команды в каталоге установочного файла
sudo sh tophatgtz_latest.run
завершите установку согласно подсказке.
Как использовать?
После установки вы можете запустить tophat-gtz напрямую без каких-либо других зависимостей. (Если bowtie / bowtie2 не установлено в среде, он будет установлен автоматически при установке tophat.)
Если y выбрано при установке «создать программную ссылку на / usr / bin», вы можете запустить tophat-gtz в любом каталоге; В противном случае вам нужно перейти в каталог установки и запустить с./ tophat-gtz.
Пакет поддержки
GTX.Zip для tophat на основе версии 2.1.2. Среди них: добавлена возможность чтения файлов GTZ напрямую, а все функции полностью соответствуют основной функции кода функции tophat.
Примеры использования
Шаг первый: используйте bowtie / bowtie2 (bowtie2-gtz) для создания index.
bowtie2-build ref.fa ref_index
* Примечание. Для создания индекса рекомендуется использовать галстук-бабочку 2 / галстук-бабочку 2-gtz, потому что для галстука-бабочки в шляпе может использоваться только галстук-бабочка 1.1.2 и предыдущие версии.
Шаг второй: сравнение выполнения
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
tophat-gtz -o каталог_отчета ref_index reads_1.fq.gtz reads_2.fq.gtz
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , который может ускорить обработку tophat-gtz.Потому что, когда tophat-gtz нужен файл RBIN и он не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ / .config / gtz, он будет загружен через сеть, что займет время.
производительность
Тестовая команда
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
tophat -o каталог_отчета -p 4 ref_index reads_1.fq.gz reads_2.fq.gz
tophat-gtz -o report_dir -p 4 ref_index reads_1.fq.gtz reads_2.fq.gtz
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: read1.fq.gz (1,55 ГБ), read2.fq.gz (1,78 ГБ), read1.fq.gtz (0,43 ГБ), read2.fq.gtz (0,61 ГБ)
Рабочие характеристики
Программное обеспечение цилиндр tophat-gtz
Расход времени 133m12.61s 134m43.02s

Программное обеспечение	цилиндр	tophat-gtz
Расход времени	133m12.61s	134m43.02s

7 、 HISAT2 для GTZ (поддержка версии GTZ

<2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https://gtz.io/hisat2gtz_latest.run -o /tmp/hisat2gtz.run && sh /tmp/hisat2gtz.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить minimap2-gtz в любом каталоге.
или
скачать установочные файлы ： -GTX.Заархивируйте hisat2-gtz-, затем установите:
sh hisat2gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти и снова войти в систему
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https://gtz.io/hisat2gtz_latest.run -o /tmp/hisat2gtz.run && sudo sh /tmp/hisat2gtz.run
или
скачать установочные файлы ： -GTX.Почтовый индекс hisat2-gtz-
судо sh hisat2gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить hisat2-gtz и hisat2-build в любом каталоге.
Как использовать?
После завершения установки программа выполнения и соответствующие сценарии будут созданы в каталоге установки, например hisat2-gtz, hisat2-build и т. Д.
Пакет поддержки GTX.Zip для hisat2, основанный на версии hisat2 (2.1.0), который: Добавлена возможность прямого чтения файлов gtz, все функции точно такие же, как и функция основного кода hisat2.
Примеры использования gtz
Шаг первый: используйте hisat2-build для создания index.
hisat2-build -p 4 ~ / GCF_000001405.37_GRCh48.p11_genomic.fna геном
Шаг второй: сравнение выполнения
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
hisat2-gtz -x геном -1 reads_1.fq.gtz -2 reads_2.fq.gtz -S result.sam
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , который может ускорить обработку hisat2-gtz.Потому что, когда hisat2-gtz нужен файл RBIN и он не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ / .config / gtz, он будет загружен по сети, что займет время.
производительность
Тестовая команда
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
hisat2 -x геном -1 reads_1.fq.gz -2 reads_2.fq.gz -S gz.sam -p 16 --reorder
hisat2-gtz -x геном -1 reads_1.fq.gtz -2 reads_2.fq.gtz -S gtz.sam -p 16 --reorder
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: read1.fq.gz (7,3 ГБ), read2.fq.gz (7,3 ГБ), read1.fq.gtz (1,6 ГБ), read2.fq.gtz (1,8 ГБ)
Рабочие характеристики
Программное обеспечение hisat2 hisat2-gtz
Расход времени 8м 25,845с 10 м 47 9 30 сек

Программное обеспечение	hisat2	hisat2-gtz
Расход времени	8м 25,845с	10 м 47 9 30 сек

8 、 MEGAHIT для GTZ (поддержка версии GTZ

<2.x.x)

Как установить?
Для установки можно (рекомендуется)
```
  `sudo curl -SL https://gtz.io/megahitgtz_latest.run -o /tmp/megahitgtz.run && sudo sh / tmp / megahitgtz.run`
  
```
или
скачать установочные файлы ： -GTX.Zip megahit-gtz-
Выполнить команды в каталоге установочного файла sudo sh megahitgtz_latest.run
завершите установку согласно подсказке.
Как использовать?
После установки будет сгенерирован megahit-gtz (и megahit_asm_core, megahit_sdbg_build, megahit_toolkit).
Если при установке y выбрано «создать программную ссылку на / usr / bin», вы можете запустить megahit-gtz в любом каталоге; В противном случае вам нужно перейти в каталог установки и запустить с ./megahit-gtz.
Пакет поддержки
GTX.Zip для мегахита на основе версии 1.1.3. Среди них: добавлена возможность читать файлы GTZ напрямую, а все функции полностью соответствуют основной функции кода мегахита.
Примеры использования
Пример 1: поддержка fq
мегахит-гтз -1 пэ1.fq -2 pe2.fq -o out
Пример 2: поддержка GTZ
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
мегахит-gtz -1 pe1.fq.gtz -2 pe2.fq.gtz -o out
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , что позволяет ускорить обработку мегахит-гтз. Потому что, когда megahit-gtz нужен файл RBIN и он не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ /.config / gtz, он будет загружен по сети, что потребует времени.
производительность
Тестовая команда
мегахит -t 16 -o выход -1 pe1.fq.gz -2 pe2.fq.gz
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
мегахит-gtz -t 16 -o выход -1 pe1.fq.gtz -2 pe2.fq.gtz
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: read1.fq.gz (1,55 ГБ), read2.fq.gz (1,78 ГБ), read1.fq.gtz (0,43 ГБ), read2.fq.gtz (0,61 ГБ)
Рабочие характеристики
Программное обеспечение мегахит мегахит-гтз
Расход времени 67м38.381с 66м 44,151с

Программное обеспечение	мегахит	мегахит-гтз
Расход времени	67м38.381с	66м 44,151с

9 、 FASTQC для GTZ (поддержка версии gtz

<2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https: // gtz.io / fastqc_gtz_latest.run -o /tmp/fastqc2gtz.run && sh /tmp/fastqc2gtz.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить minimap2-gtz в любом каталоге.
или
скачать установочные файлы ： -GTX.Zip fastqc-gtz- ，
, затем установите
sh fastqc_gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ /.bashrc или выйдите и войдите снова
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https://gtz.io/fastqc_gtz_latest.run -o /tmp/fastqc2gtz.run && sudo sh /tmp/fastqc2gtz.run
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip fastqc-gtz- ， затем установите
судо sh fastqc_gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить fastqc-gtz в любом каталоге
Как использовать?
После завершения установки программа выполнения и соответствующие сценарии будут созданы в каталоге установки.Пакет поддержки GTX.Zip для fastqc, основанный на версии fastqc (0.11.8), который: Добавлена возможность прямого чтения файлов gtz, все функции точно такие же, как функция основного кода fastqc.
Примеры использования
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
fastqc-gtz -t 1 reads_1.fq.gtz -o ~ / каталог_результатов
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , который может ускорить обработку fastqc-gtz.Поскольку, когда fastqc-gtz нужен файл RBIN и он не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ / .config / gtz, он будет загружен по сети, что займет время.

10 、 FASTP для GTZ (поддержка версии gtz 2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка непосредственно из командной строки (рекомендуемый метод установки)
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
sudo curl -SL https://gtz.io/fastpgtz_latest.запустить -o /tmp/fastpgtz.run && sudo sh /tmp/fastpgtz.run
После установки исполняемый файл fastp-gtz помещается в каталог / usr / local / fastp-gtz, мягкая ссылка fastp-gtz создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
curl -SL https://gtz.io/fastpgtz_latest.run -o /tmp/fastpgtz.run && sh /tmp/fastpgtz.run && source ~ / .bashrc
После установки исполняемый файл fastp-gtz помещается в ~ /.config / fastp-gtz, псевдоним fastp-gtz добавлен в ~ / .bashrc
Mode 2: Сначала загрузите программное обеспечение, а затем установите его.
Сначала загрузите программное обеспечение с -GTX.Zip Professional-.
Коммерчески авторизованные пользователи обращаются по адресу [email protected].
Установить для ВСЕХ ПОЛЬЗОВАТЕЛЕЙ:
sudo sh fastpgtz_latest.run
После установки исполняемый файл fastp-gtz помещается в каталог / usr / local / fastp-gtz, мягкая ссылка fastp-gtz создается в / usr / bin
Устанавливать только для ТЕКУЩЕГО ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:
sh fastpgtz_latest.запустите && source ~ / .bashrc
После установки исполняемый файл fastp-gtz помещается в каталог ~ / .config / fastp-gtz текущего пользователя, псевдоним fastp-gtz добавляется в ~ / .bashrc
После завершения установки вы можете выполнить fastp-gtz в любом каталоге

Как использовать?

Gtx. Заархивируйте в fastp в пакете поддержки, основанном на FASTP версии 0.19.5. И ввод, и вывод поддерживают файлы в формате GTZ и не в формате GTZ, и когда имя выходного файла заканчивается расширением.gtz, fastp-gtz сжимает выходной файл GTZ

1. Ввод не в формате GTZ

примеров:

Выходной формат GTZ:

fastp-gtz -i in.fq -o out.fq.gtz --ref in.fq.species.fasta

Выходной формат без GTZ:

fastp-gtz -i in.fq -o out.fq

Инструкции по использованию —ref см. В следующих разделах.

2. Ввод в формате GTZ

примеров:

Шаг 1: Пропустите этот шаг, если считывается декомпрессия.gtz не требует справочного файла, в противном случае укажите соответствующую ссылку следующим образом:

экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin / (Подходит для версии gtx1.x.x, укажите путь к файлу rbin для распаковки, рекомендуется, но не требуется, если не указано, gtz загрузится автоматически, займет определенное время)

экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / fasta / xxx.fa (подходит для версии gtx2.x.x, указывает соответствующий файл fasta для распаковки, обязательно)

Шаг второй: анализ выполнения

fastp-gtz -i дюйм.R1.fq.gtz -I in.R2.fq.gtz -o out.R1.fq.gtz -O out.R2.fq.gtz --ref in.fq.species.fasta

Другие способы использования:

fastp-gtz -i in.R1.fq.gtz -I in.R2.fq.gtz -o out.R1.fq.gtz -O out.R2.fq.gtz --ref in.fq.species. fasta --donot_pack_ref --cache_path / cache / path /

Описание команды:

—ref

  Этот параметр рекомендуется указывать, указывает Fasta соответствующий сжатому файлу

—donot_pack_ref

  при использовании этого параметра необходимо указать справочный файл при распаковке, здесь он находится в формате.fq.species.fasta

—cache_path

  Путь кэша по умолчанию ~ / .config / gtz, вы также можете использовать его, чтобы указать другой путь

Как это работает:

При вводе в виде файла GTZ, FASTP-GTZ можно кратко описать как четыре процедуры:

  (A) читать в In.gtz-> (B) разархивировать в In.fq-> (C) обрабатывать данные-> (D) сжатые в IN.GTZ

Примечание

1) Процесс B

  и.Если in.gtz в процессе A является версией файла сжатия с большим множителем gtz 1.x.x, то для процесса B требуется соответствующий файл rbin, тогда есть два способа работы:
 
 Первый режим:
     У вас есть файл Rbin локально и укажите путь к файлу со следующими переменными среды:
     
     экспорт GTZ_RBIN_PATH = / путь / rbin
     Затем программа завершит шаг b, используя локальный файл Rbin.
 Второй режим:
     У вас нет файла Rbin локально или вы не указываете его через переменную среды, и в этом случае программа автоматически загружает Rbin из сети, и, конечно, процесс занимает определенное количество времени
     
II.Если in.gtz в процессе A является версией gtz 2.x.x сжатого файла с высоким коэффициентом множителя, то процесс B также работает двумя способами:

Первый режим:
In.gtz создается с использованием --donot-pack-ref, мы должны указать файл fasta, который используется при сжатии следующими переменными среды:
  
  экспорт GTZ_RBIN_PATH = / путь / fasta / xxx.fa
Второй режим:
in.gtz генерация не используется - donot-pack-ref, тогда процедура B не требует дополнительных параметров

2) Процесс C

3) Процесс D

  Первый режим:
     Файл FASTA не указан, out.R1.fq.gtz и out.R2.fq.gtz генерируются обычным сжатием
 Второй режим:
     Файл FASTA задается параметром --ref, out.R1.fq.gtz и out.R2.fq.gtz генерируются непосредственно с помощью сжатия с высокой степенью сжатия.

производительность
Тестовая команда
fastp -i in.R1.fq.gz -I in.R2.fq.gz -o out.R1.fq.gz -O out.R2.fq.gz
fastp-gtz -i in.R1.fq.gtz -I in.R2.fq.gtz -o out.R1.fq.gtz -O out.R2.fq.gtz --ref in.fq.species.bin
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти; размер файла: дюйм R1.fq.gz (1,55 ГБ), дюйм R2.fq.gz (1,78 ГБ), дюйм R1.fq.gtz (0,43 ГБ), дюйм R2.fq.gtz (0,61 ГБ)
Рабочие характеристики
Общий размер выходного файла fastp для R1.fq.gz и out.R2.fq.gz составляет 3,3 ГБ, а общий размер выходного файла fastp-gtz для R1.fq.gtz и out.R2.fq.gtz составляет 1 ГБ

11 、 MINIMAP2 для GTZ (поддержка версии gtz

<2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https: // gtz.io / minimap2_gtz_latest.run -o /tmp/minimap2_gtz_latest.run && sh /tmp/minimap2_gtz_latest.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить minimap2-gtz в любом каталоге
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip minimap2-gtz- ， затем установите
sh minimap2_gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ /.bashrc или выйдите и войдите снова
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https://gtz.io/minimap2_gtz_latest.run -o /tmp/minimap2_gtz_latest.run && sudo sh /tmp/minimap2_gtz_latest.run
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip minimap2-gtz- ， затем установите
sudo sh minimap2_gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить minimap2-gtz в любом каталоге
После установки будет сгенерирована minimap2-gtz.
Примеры использования
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
minimap2-gtz -ax asm20 ref.fa pacbio-ccs.fq.gtz> aln.sam
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , который может ускорить обработку файла minimap2-gtz. Поскольку, когда minimap2-gtz нуждается в файле RBIN и не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ /.config / gtz, он будет загружен по сети, что потребует времени.
Тестовая команда
minimap2 -t 16 -a Arab.mmi Arab_E822-R02-I_good_1.fq.gz> Arab_p.sam
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
minimap2-gtz -t 16 -a Arab.mmi Arab_E822-R02-I_good_1.fq.gz.gtz> Arab_gtz_p.sam
Среда тестирования
Конфигурация сервера: 16-ядерный ЦП, 64 ГБ памяти;
Рабочие характеристики
Программное обеспечение миникарта2 minimap2-gtz
Расход времени 2 мин. 57 сек. 3м 57.151с

Программное обеспечение	миникарта2	minimap2-gtz
Расход времени	2 мин. 57 сек.	3м 57.151с

12 、 WTDBG2 для GTZ (поддержка версии gtz

<2.x.x)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https://gtz.io/wtdbg2_gtz_latest.run -o /tmp/wtdbg2_gtz_latest.run && sh /tmp/wtdbg2_gtz_latest.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ /.bashrc или выйдите, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить wtdbg2-gtz в любом каталоге
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip wtdbg2-gtz- ， затем установите
ш wtdbg2_gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти и снова войти в систему
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https: // gtz.io / wtdbg2_gtz_latest.run -o /tmp/wtdbg2_gtz_latest.run && sudo sh /tmp/wtdbg2_gtz_latest.run
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip wtdbg2-gtz- ， затем установите
судо ш wtdbg2_gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить wtdbg2-gtz в любом каталоге
После установки будет сгенерирован wtdbg2-gtz.
Примеры использования
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /
wtdbg2-gtz -x rs -g 4.6m -t 16 -i wtdbg2_test.fastq.gtz -fo префикс
wtpoa-cns -t 16 -i prefix.ctg.lay.gz -fo prefix.ctg.fa
* В этом примере путь к файлу RBIN задается переменной среды GTZ_RBIN_PATH, где «export GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin /» не требуется, но если вы знаете путь к rbin, рекомендуется указать его. , что может ускорить обработку wtdbg2-gtz. Поскольку, когда wtdbg2-gtz нуждается в файле RBIN и не может найти файл RBIN по пути по умолчанию ~ /.config / gtz, он будет загружен по сети, что потребует времени.

13 、 BWA-MEM2 для GTZ (поддержка gtz версии 3.0.1)

Как установить?
Режим 1: установка для текущего пользователя, разрешения sudo не требуются
Для установки можно (рекомендуется)
curl -SL https://gtz.io/bwamem2-gtz_latest.run -o /tmp/bwamem2gtz.run && sh /tmp/bwamem2gtz.run
После первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ /.bashrc или выйти, чтобы снова войти в систему, а затем вы можете выполнить bwa-mem2-gtz в любом каталоге
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip bwa-mem2-gtz- ， затем установите
ш bwamem2-gtz_latest.run
Точно так же после первой установки вам нужно выполнить исходный код ~ / .bashrc или выйти и снова войти в систему
Режим два: установка для всех пользователей, требуются разрешения sudo
Для установки можно (рекомендуется)
sudo curl -SL https: // gtz.io / bwamem2-gtz_latest.run -o /tmp/bwamem2gtz.run && sh /tmp/bwamem2gtz.run
или
загрузите установочные файлы ： -GTX.Zip bwa-mem2-gtz- ， затем установите
судо ш bwamem2-gtz_latest.run
После завершения установки вы можете выполнить bwa-mem2-gtz в любом каталоге.
Пакет поддержки
GTX.Zip для bwa-mem2 основан на выпуске 2.1 bwa-mem2.
Используется так же, как и исходный bwa-mem2, за исключением того, что добавляется сжатый файл в формате GTZ.
Шаг 1: сделайте индекс
bwa-mem2-gtz, индекс исх.fasta
Шаг 2: сопоставление
В случае 1 входным файлом является формат fq / fq.gz, прямое отображение
bwa-mem2-gtz mem ref.fasta read.fq.gz -t 20> out.sam
В случае 2 входной файл имеет формат GTZ
Шаг первый: пропустите этот шаг, если для распаковки read.gtz не требуется справочный файл, в противном случае укажите соответствующую ссылку следующим образом:
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / rbin / (подходит для gtx1.x.x, укажите путь к файлу rbin для распаковки, рекомендуется, но не требуется, если не указано иное, gtz загрузится автоматически, на это потребуется определенное время)
экспорт GTZ_RBIN_PATH = / path / fasta / xxx.fa (подходит для версии gtz3.0.1, указывает соответствующий файл fasta для распаковки, обязательно)
Шаг второй: сопоставление
bwa-mem2-gtz mem ref.fasta read.gtz -t 20> out.sam
устанавливает поток декомпрессии на 4 чтения.gtz для выполнения сопоставления (поток распаковки по умолчанию равен 1, если он не установлен)
экспорт GTZ_CONCURRENC = 4 && bwa-mem2-gtz mem ref.fasta read.gtz -t 20> out.sam
производительность

-В начало-

История изменений

Текущая последняя версия ： gtz-3.0.1 [2021/04/06]

историческая версия: -Журнал изменений-

FAQ

Часто задаваемые вопросы призваны помочь новичкам понять, как мы работаем! -Нажмите здесь！ —

Свяжитесь с нами

Если у вас есть вопросы, обращайтесь: contact @ gtz.io или создайте новый выпуск GitHub.

-Назад к началу-

Лицензия

Подробнее см.

Разное